Modul Praktikum Virologi

MODUL PRAKTIKUM VIROLOGI

TIM PENULIS : TINGKAT III KELOMPOK B

POLTEKKES KEMENKES PALEMBANG JURUSAN DIII ANALIS KESEHATAN TAHUN AKADEMIK 2017 / 2018

SAMBUTAN PIMPINAN INSTANSI

(DIBUAT OLEH PIMPINAN INSTANSI)

TEMPAT, TANGGAL JABATAN,

(TTD DAN STEMPEL INSTANSI)

NAMA NIP

KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Kuasa atas segala limpahan Rahmat-Nya sehingga kami dapat menyelesaikan penyusunan makalah ini dalam bentuk maupun isinya yang sangat sederhana. Semoga makalah ini dapat dipergunakan sebagai salah satu acuan, petunjuk maupun pedoman bagi pembaca. Harapan kami semoga makalah ini membantu menambah pengetahuan dan pengalaman bagi para pembaca, sehingga kami dapat memperbaiki bentuk maupun isi makalah ini sehingga kedepannya dapat lebih baik. Makalah ini kami akui masih banyak kekurangan karena pengalaman yang kami miliki sangat kurang. Oleh kerena itu kami harapkan kepada para pembaca untuk

memberikan

masukan-masukan

yang

bersifat

membangun

untuk

kesempurnaan makalah ini.

Palembang, November 2017

Penyusun

DAFTAR ISI

Halaman HALAMAN SAMPUL ........................................................................................ i KATA PENGANTAR .......................................................................................iii DAFTAR ISI ...................................................................................................... iv DAFTAR TABEL ................................................................................................. DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ BAGIAN 1 INOKULASI PADA TELUR AYAM ............................................ 1 SUB TOPIK/SUB JUDUL......................................................................1 TUJUAN INSTRUKSIONAL ................................................................1 INDIKATOR ..........................................................................................1 URAIAN MATERI .................................................................................1 LATIHAN PEMAHAMAN ....................................................................14 GLOSARIUM .........................................................................................16 DAFTAR REFERENSI ..........................................................................17 BAGIAN 2 VIRUS DNA & VIRUS RNA ....................................................... 18 SUB TOPIK/SUB JUDUL......................................................................18 TUJUAN INSTRUKSIONAL ................................................................18 INDIKATOR ..........................................................................................18 URAIAN MATERI .................................................................................18 RINGKASAN .........................................................................................40 LATIHAN PEMAHAMAN ....................................................................41 DAFTAR PUSTAKA .............................................................................43 BAGIAN 4 BAKTERIOFAGE......................................................................... 44

SUB TOPIK/SUB JUDUL......................................................................44 TUJUAN INSTRUKSIONAL ................................................................44 INDIKATOR ..........................................................................................44 URAIAN MATERI .................................................................................44 RINGKASAN .........................................................................................48 LATIHAN PEMAHAMAN ....................................................................49 GLOSARIUM .........................................................................................49 DAFTAR PUSTAKA .............................................................................50 BAGIAN 5 VAKSIN VIRUS ............................................................................... SUB TOPIK/SUB JUDUL...................................................................... TUJUAN INSTRUKSIONAL ................................................................ INDIKATOR .......................................................................................... URAIAN MATERI ................................................................................. RINGKASAN ......................................................................................... LATIHAN PEMAHAMAN .................................................................... GLOSARIUM ......................................................................................... DAFTAR PUSTAKA ............................................................................. BAGIAN 6 JAMINAN MUTU PEMERIKSAAN VIROLOGI ........................... SUB TOPIK/SUB JUDUL...................................................................... TUJUAN INSTRUKSIONAL ................................................................ INDIKATOR .......................................................................................... URAIAN MATERI ................................................................................. RINGKASAN ......................................................................................... LATIHAN PEMAHAMAN .................................................................... GLOSARIUM .........................................................................................

DAFTAR PUSTAKA .............................................................................

DAFTAR TABEL

Halaman Tabel 1 ...................................................................................................................

DAFTAR GAMBAR

Halaman Gambar 1 ...............................................................................................................

BAGIAN 1

SUB TOPIK/SUB JUDUL

: Inokulasi Virus pada Telur Ayam Berembrio

TUJUAN INSTRUKSIONAL : Mampu melakukan metode pengkayaan / isolasi dan identifikasi virus. INDIKATOR

: Mampu melakukan isolasi pada telur ayam berembrio.

URAIAN MATERI I.

:

LATAR BELAKANG Newcastle disease biasa dikenal sebagai penyakit tetelo, merupakan

penyakit unggas, khususnya ayam bersifat sangat mudah menular, akut serta menimbulkan gejala gangguan pencernaan, pernafasan dan syaraf. Penyakit tersebut

disebabkan

oleh

virus

tetelo,

genus

Paramixovirus,

keluarga

Paramixoviridae. Virus tetelo merupakan virus RNA yang mempunyai genom single stranded (SS) dengan polaritas negatif. Paramixovirus berbentuk sangat pleomorfik, antara bentuk membulat sampai filamen serta berdiameter 100 sampai 150 nµ. Nukleokapsid bersimetri heliks dan dikelilingi oleh amplop yang berasal dari membran permukaan sel. Pada amplop tersebut menempel spike glikoprotein hemaglutinin (H/ HA) dan neuraminidase (N/NA). Spike tersebut mempunyai peran dalam hemaglutinasi eritrosit dan proses elusi (Alexander, 1991; Alexander, 2003; Allan et al., 1978; Fenner et al., 1993), dan merupakan salah satu sifat virus tetelo yang dapat digunakan dalam karakterisasi biologi virus tersebut.

Hemaglutinin virus tetelo mempunyai kemampuan berikatan secara spesifik dengan reseptor asam sialat yang terdapat pada membran plasma sel darah merah (SDM) ayam, di samping SDM unggas, juga mengaglutinasi eritrosit marmot dan manusia. Beberapa strain tertentu mempunyai kemampuan mengagglutinasi SDM mamalia, yaitu sapi, kuda, domba dan babi (Alexateteloer, 2003), tikus putih, kelinci, dan kucing (Chu, 1948). Sifat tersebut dapat digunakan sebagai penanda strain virus tetelo meskipun tidak mempengaruhi perbedaan dalam uji serologi. Proses hemaglutinasi terjadi karena SDM yang dicampur dengan virus tetelo dalam proporsi yang seimbang. Koteteloisi tersebut dapat terjadi karena adanya kecocokan virus tetelo dengan reseptor yang terdapat pada permukaan SDM. Beberapa faktor yang memengaruhi uji HA tersebut, antara lain: konsentrasi SDM berkisar 1%, pelarut mengandung elektrolit (0,85% NaCl) dan partikel virus mencapai 105 sampai 106 per mL suspensi (NRC, 1971). Virus tetelo yang memperlihatkan uji HA positif dapat dihambat oleh antibodi spesifik yang dihasilkan oleh hemaglutinin virus tetelo. Aktivitas hambatan hemaglutinasi tersebut dapat digunakan sebagai dasar yang memungkinkan identifikasi virus tetelo (Alexander, 2003). Hemaglutinat yang terbentuk pada HA positif dapat terurai kembali oleh aktivitas enzim neuraminidase. Proses tersebut dinamakan elusi. Stabilitas hemaglutinat di antara virus tetelo bervariasi, beberapa strain virus tetelo menunjukkan elusi cepat kurang dari 24 jam tetapi bebapa strain menunjukkan elusi lambat, yaitu lebih dari 24 jam (Spalatin et al., 1970). Menurut Ezeibe dan Ndeip (2005) waktu elusi beberapa virus tetelo bervariasi. Virus patotipe velogenik mempunyai waktu elusi dari 84 sampai 189 menit, sedangkan virus mesogenik mempunyai waktu elusi antara 43 sampai 78 menit. Virus yang termasuk lentogenik dalam penelitian tersebut dipakai strain La Sota mempunyai waktu elusi 20 sampai 45 menit. Proses elusi virus tetelo dapat meningkat pada suhu 37 C, tetapi dapat tertunda apabila ditempatkan pada suhu 4 C (Chu, 1948).

Virus tetelo apabila dipanaskan pada suhu 56 C dalam periode waktu tertentu dapat kehilangan kemampuan untuk dapat melakukan hemaglutinasi SDM, karena hemaglutinin rusak. Stabilitas hemaglutinin pada pemanasan tersebut berbeda-beda di antara strain. Strain virus tetelo dikatakan resisten apabila hemaglutinin tidak rusak oleh pemanasan suhu 56 C selama 30 menit, sedangkan dikatakan sensitif jika hemaglutinin rusak oleh pemanasan tersebut. Pemanasan 70 C selama 30 menit dapat menghilangkan kemampuan hemaglutinasi virus tetelo (Chu, 1948). Isolasi virus tetelo dapat dilakukan secara in ovo menggunakan telur ayam berembrio umur 9-12 hari specific pathogen free atau setidaknya bebas antibodi terhadap virus tetelo. Sejauh ini inokulasi ditempatkan pada ruang alantois dianggap yang paling peka, meskipun inokulasi pada ruang amnion maupun pada yolk sac dapat juga dipertimbangkan (Alexander, 1989). Pertumbuhan virus dapat menyebabkan kematian embrio, meskipun antar strain virus tetelo juga bervariasi. Kematian embrio akibat infeksi virus tetelo tersebut dapat dipakai sebagai evaluasi virulensi virus yang dikenal dengan chick embryo virulence (CEV). Virus tetelo dikatakan virulen jika dapat menyebabkan kematian embrio dalam 48 jam, moderat jika mampu menyebabkan kematian 50% embrio dalam waktu 48 jam. Virus tersebut dikatakan kurang virulen jika tidak menyebabkan kematian embrio dalam waktu 48 jam. Alexander (2003) membedakan virus tetelo sebagai patotipe velogenik, mesogenik, dan lentogenik berdasarkan kemampuan Wibowo et al Jurnal Veteriner 427 menyebabkan kematan embrio ayam berturutturut kurang dari 60 jam, antara 60 sampai 90 jam dan di atas 90 jam. Kemampuan menyebabkan kematian embrio tersebut juga dapat dipakai untuk mengira patogenisitas virus pada ayam. Pertumbuhan virus tetelo dalam cairan alantois diketahui dengan melihat kemampuan hemaglutinasi eritrosit. Identifikasi secara serologi menggunakan serum anti spesifik terahadap virus tetelo dengan uji hamaglutinasi inhibisi (HI) (Alexander, 1989; Fenner, 1993). Diagnosis yang dewasa ini banyak dikembangkan adalah dengan metode reverse transcriptase polymerase chain (RT-

PCR). Cairan alantois yang memperlihatkan hasil uji HA dan HI positif tersebut, dapat dipreparasi RNA virus target dan selanjutnya dapat diamplifikasi dengan metode RT-PCR. Secara umum identifikasi molekuler ditujukan pada gen F (fusi) yang merupakan prekursor glikoprotein yang berperan dalam cleavage untuk proses fusi sel (Alexander, 2003). Sensitivitas diagnosis RT-PCR bervariasi pada berbagai tingkatan kasus klinis penyakit tetelo, yaitu 73,44% sampai 91,30% (Creelan et al., 2002). Gejala klinis akibat infeksi virus tetelo dapat bervariasi tergantung patotipe virus, kepekaan inang dan faktor pendukung lainnya. Penyakit tetelo tipe Asiatik yang dikenal sebagai very virulent tetelo dapat menyebabkan kematian tinggi mencapai 100% pada unggas yang peka (Alexander, 2003) dan oleh sebab itu dapat menimbulkan kerugian ekonomi yang cukup nyata di sektor usaha peternakan unggas di Indonesia. Pada ayam kampung yang dikenal mempunyai resistensi yang tinggi terhadap berbagai penyakit unggaspun, infeksi virus tetelo mampu menyebakan kematian mencapai lebih 50% populasi per tahun (Folitse et al., 1998). Sejauh ini usaha penanggulangan penyakit tetelo tersebut dilakukan dengan vaksinasi dan didukung dengan praktek manajemen yang optimal. Vakinasi tetelo dilakukan dengan cara pemberian vaksin aktif dan inaktif pada berbagai tingkatan umur ayam. Meskipun berbagai usaha telah dilakukan dalam rangka penanggulangan penyakit tersebut, namun tidak bisa dipungkiri bahwa sampai saat ini kasus tetelo masih banyak ditemukan di lapangan. Kasus penyakit tetelo tersebut dapat muncul pada suatu peternakan yang telah menjalankan vaksinasi dengan baik maupun pada peternakan ayam kampung yang belum melakukan program vaksinasi tetelo. Kondisi tersebut memberikan suatu alasan bahwa masih banyak permasalahan di lapangan, sehingga dapat terjadi kasus penyakit tetelo. Beberapa sebab yang mungkin terkait munculnya kasus tersebut adalah menyangkut masalah tata laksana peternakan, kualitas vaksin yang sangat bervariasi, serta variasi patotipe virus yang bersirkulasi di lapangan. Lebih dari itu telah muncul dugaan adanya virus tetelo yang berbeda dari yang selama ini

dikenali, meskipun untuk tahu hal tersebut harus dilakukan karakterisasi lebih lanjut secara molekuler.

II. TUJUAN Tujuan praktikum inokulasi virus pada telur berembrio adalah untuk memberikan pemahaman tentang macam-macam inokulasi virus, mengetahui bagaimana cara menginokulasikan virus pada telur ayam berembrio, dan mengetahui ciri-ciri embrio ayam yang terinfeksi virus New Castle disease (ND).

III. MATERI DAN METODE A. Materi Alat dan bahan yang digunakan dalam praktikum ini adalah senter, pensil, kapas, jarum pentul, spuit injeksi, cawan petri, pinset, baki, telur ayam berembrio umur 9-12 hari, serum ND, alcohol 70%.

B. Metode 1. Siapkan telur ayam berumur 9-12 hari. 2. Telur diteropong untuk menentukan batas antara kantung udara dengan letak kepala embrio, kemudian diberi tanda dengan pensil. 3. Oleskankapas alcohol pada daerah kantung udara. 4. Telur ditusuk terlebih dahulu dengan jarum pentul. 5. Serum diinokulasi kedalam ruang allantois (melewati batas kantung udara) dengan cara menusuk telur dengan spui tinjeksi ᶾ/₄ inci dengan sudut 45C dan diinjeksikan sebanyak 0,1 cc, 0,3 cc, dan 0,5 cc. 6. Bagian yang berlubang ditutup dengan lilin. 7. Telur diinkubasi suhu 39C selama 4 hari. 8. Telur diamati pada hari ke-4 dan dibandingkan dengan telur yang tidak diinokulasikan virus.

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN A. Hasil Kelompok

Titer

Warna Kaki

LesiEmbrio

LesiOtotdanBulu

1.

0,1 cc

+

+

+

2.

0,3 cc

-

-

+

3.

0,1 cc

+

+

+

4.

0,2 cc

-

++

-

5.

0,3 cc

+

+++

+

6.

0,1 cc

++

+++

Perkembangan abnormal

Keterangan: (-)

: tidak ada

(+)

: ada sedikit

(++)

: sedang

(+++)

: banyak

B. Pembahasan Berdasarkan pengamatan embrio ayam yang telah diinkubasi selama tujuh hari, didapatkan hasil bahwa embrio pada kelompok 1 dan 3 yang diinokulasikan virus 0,1 cc mengalami perubahan warna hijau pada kaki, lesi pada embrio, maupun lesi pada otot dan bulu. Embrio kelompok 5 dengan inokulasi virus 0,3 cc juga terdapat perubahan warna hijau pada kaki, lesi pada otot dan bulu dan terdapat banyak lesi pada embrio. Kelompok 2 embrio diinokulasi virus sebanyak 0,3 cc tidak ada perubahan warna hijau pada kaki, tidak terdapat lesi pada embrio dan terdapat lesi pada otot dan buku embrio. Kelompok 4 dengan embrio yang diinokulasi virus 0,2 cc tidak terdapat perubahan warna hijau pada kaki, tidak terdapat lesi pada otot dan bulu dan terdapat lesi sedang pada embrio. Kelompok 6 pada embrio yang diinokulasi virus 0,1 cc terdapat perubahan warna hijau pada kaki, terdapat lesi yang banyak pada

embrio dan terdapat lesi pada otot dan bulu. Sesuai dengan pernyataan Shane (1998) bahwa bukti dari infkesi virus pada embrio ayam ditunjukkan dengan kematian embrio, pembentukan lesi pada CAM, lesi pada embrio, perkembangan otot dan buku yang abnormal, abnormalitas pada organ visceral dan perubahan warna kehijauan pada kaki. Newcastle Disease Virus (NDV) apabila berada berada pada chorioalantois maka akan mengalami tiga tahap perkembangan virus. Tahap

pertama ditandai dengan dimulainya hipertrofi, hiperplasia sel dan

kehadiran dari sedikit badan inklusi sitoplasma yang biasanya ditemukan dalam sel. Tahap 2, juxtanuclear agregat nukleokapsid-glikogen muncul dan ada peningkatan jumlah mikrovili. Tahap 3 yang ditandai dengan peningkatan kepadatan sitoplasma, perakitan virus dan pelepasan (Feller, 1969). Keberhasilan

dalam

mengisolasi

dan

mengembangkan

virus

tergantung pada beberapa kondisi yaitu rute inokulasi, umur embrio, temperatur inkubasi, waktu inkubasi setelah inokulasi, volume dan pengenceran dari inokulum yang digunakan, status imun dari kelompok dimana telur ayam berada. Fenner (1995) menambahkan bahwa produksi antibodi berlangsung dengan cepat setelah terinfeksi NDV. Antibodi penghambat hemaglutinasi dapat diamati dalam waktu 4-6 hari setelah infeksi. Antibodi yangberasal dari induk dapat melindungi anak ayam sampai 3-4 minggu setelah menetas. Antibodi 0 IgA yang dihasilkan secara lokal berperan penting dalam melindungi saluran pernafasan dan saluran pencernaan. Newcastle disease (ND) merupakan salah satu penyakit infeksi yang penting untuk dikaji dalam peternakan. Newcastle disease juga dikenal dengan nama sampar ayam atau tetelo. Deteksi yang cepat dan identifikasi dari virus ini merupakan tahap yang paling efektif untuk mengontrol pertumbuhan penyakit ini (Smietanka et al., 2006). Newcastle disease disebabkan oleh Paramyxovirus yang merupakan anggota dari familia Paramyxoviridae. ,Newcastle Disease Newcastle Disease (ND) adalah penyakit yang sangat menular dengan, angka kematian yang tinggi. Newcastle Disease (ND) atau tetelo disebabkan oleh Newcastle Disease virus, yang termasuk dalam famili Paramyxoviridae, genus Paramyxovirus (Ge et al., 2007). Panjangnya 15-16 kb, mempuyai kapsid simetris heliks tidak

bersegmen, biasanya berbentuk bola, dan berdiameter 13-18 nm. Genome virus ND ini adalah suatu rantai tunggal RNA berpolaritas negatif. Virus ND dibagi dua tipe yakni tipe Amerika dan tipe Asia. Pembagian ini berdasarkan keganasannya dimana tipe Asia lebih ganas dan biasanya terjadi pada musim hujan atau musin peralihan, dimana saat tersebut stamina ayam menurun sehingga penyakit mudah masuk. Tipe Asia yang ganas cepat sekali menular dan seringkali menimbulkan kematian secara mendadak (Ganwarin, 2008). Newcastle disease virus (NDV) adalah virus dengan asam nukleat berupa RNA virus dengan sejarah penularan yang klinis. Replikasi selektif pada sel tumor menunjukkan bagaimana respon antiviral untuk perlawanan terhadap sel tumor. Strain NDV dibedakan menjadi tiga pathotypes: strain sangat virulen yang menyebabkan gangguan respirasi dan syaraf di ayam, virulensi standar, dan non pathogenic (Fournier, 2012). Virus biasanya berbentuk bola dengan diameter 100–300 nm. Genom dari virus ND adalah suatu rantai tunggal RNA. Virus ND mempunyai amplop yang mengandung dua protein yaitu protein hemaglutinin neuraminidase (HN) dan protein peleburan. Kedua protein ini bersifat penting dalam menentukan keganasan dan infektivitas virus. Protein HN melaksanakan dua fungsi, yaitu hemaglutinin mengikat selaput sel inang dan bagian neuraminidase dilibatkan di dalam pelepasan virus dari selaput sel inang. Protein peleburan digunakan untuk peleburan amplop virus kepada selaput sel inang, sehingga genom dari virus dapat masuk sel. Untuk melaksanakan fungsi ini, protein peleburan perlu dibelah oleh suatu protease sel inang (Yuan et al., 2011). Virus ND menyerang alat pernapasan, susunan jaringan syaraf, serta alat-alat reproduksi telur dan menyebar dengan cepat serta menular pada banyak spesies unggas yang bersifat akut, epidemik (mewabah) dan sangat patogen. Virus ND dibagi dua tipe yakni tipe Amerika dan tipe Asia. Pembagian ini berdasarkan keganasannya dimana tipe Asia lebih ganas dan biasanya terjadi pada musim hujan atau musin peralihan, dimana saat tersebut stamina ayam menurun sehingga penyakit mudah masuk (Adi et al., 2008). Gejala klinis yang terlihat pada ayam sangat bervariasi, mulai dari yang sangat ringan sampai yang terberat. Berdasarkan hasil praktikum, telur yang

diinjeksikan virus 0,1 cc menunjukkan gejala lesi pada embrio dan telur yang diinjeksikan virus 0,3 cc menunjukkan gejala lesi pada embrio, otot, dan buku. Terlihat semakin banyak konsentrasi virus yang diberikan, gejala yang tampak juga semakin kompleks. Gejala yang timbul sesuai dengan pernyataan Alexander (1991), tanda tanda infeksi virus pada embrio ayam dapat dilihat dari kematian embrio, edema atu perkembangan plak, kekerdilan, kaki seperti memar, pembesaran hepar, organ visceral tumbuh tidak normal, hemoragi cutaneous, dan perkembangan otot yang abnormal. Menurut Beard (1984), gejala-gejala klinis pada ungggas penderita penyakit Newcastle Disease (ND) : a. Bentuk Velogenik-viscerotropik bersifat akut, menimbulkan kematian yang tinggi, mencapai 80 – 100%. Pada permulaan sakit napsu makan hilang, mencret yang kadang-kadang disertai darah, lesu, sesak napas, megap-megap, ngorok, bersin, batuk, paralisis parsial atau komplit, kadang-kadang terlihat gejala torticalis. b. Bentuk Velogenik-pneumoencephalitis gejala pernapasan dan syaraf, seperti torticalis lebih menonjol terjadi daripada velogenik-viscerotropik. Mortalitas bisa mencapai 60 – 80 %. c. Bentuk Mesogenik, pada bentuk ini terlihat gejala klinis berupa gejala respirasi, seperti batuk, bersin, sesak napas, pada anak ayam menyebabkan kematian sampai 10%, sedangkan pada ayam dewasa hanya berupa penurunan produksi telur dan hambatan pertumbuhan, tanpa menimbulkan kematian. d. Bentuk Lentogenik terlihat gejala respirasi ringan saja, tidak terlihat gejala syaraf. Bentuk ini tidak menimbulkan kematian, baik pada anak ayam maupun ayam dewasa. e. Bentuk asymptomatik,

pada galur lentogenik juga sering tidak

memperlihatkan gejala klinis. Ayam yang terinfeksi mempunyai peranan penting dalam penyebaran penyakit dan sebagai sumber infeksi. Pada mulanya virus bereplikasi pada epitel mukosa dari saluran pernafasan bagian atas dan saluran pencernaansegera setelah infeksi virus menyebar

lewat aliran darah ke ginjal dan sumsum tulang yang menyebabkan viremia skunder, ini menyebabkan infeksi pada organ seperti paru-paru, usus, dan system syaraf pusat. Kesulitan bernafas dan sesak nafas timbul akibat penyumbatan pada paru-paru dan kerusakan pada pusat pernafasan di otak (Wilden, 2012).

Gejalanya tidak spesifik,

diagnosis harus

dipastikan dengan isolasi virus dan serologi. Virus dapat diisolasi dari limpa, otak atau paru-paru melalui inokulasi alantois dari telur berembrio umur 10 hari. Penularan virus pada hewan dan manusia sangat beragam jenisnya. Penularan dapat melalui udara, makanan serta adanya vektor. Pengujian yang dilakukan terhadap adanya penularan virus dapat dilakukan dengan berbagai macam cara misalnya melalui in vivo, inovo dan in vitro (Purchase, 1989). Macam-macam cara menginokulasikan virus ke embrio ayam yaitu in ovo, in vivo, dan in vitro. Metode in ovo merupakan penanaman virus pada telur ayam yang berembrio. Metode ini dapat dilakukan dengan berbagai cara antara lain Inokulasi pada ruang chorioalantois dan Inokulasi pada membran chorioalantois. Inokulasi pada ruang chorioalantois biasanya digunakan embrio ayam dengan umur 10-12 hari. Jarum dimasukkan ¾ inci dengan sudut 45º dan diinjeksikan 0,1-0,2 ml virus yang akan diinokulasikan. Setelah 40-48 jam cairan telur yang sudah diinkubasi dapat diuji untuk hemaglutinasi dengan membuat lubang kecil pada kerabang di pinggir dari rongga udara, dengan alat semprot yang steril dan jarumnya, diambil 0,1-0,2 ml cairannya. Campur 0,5 cairan telur dengan perbandingan yang sama dari 10% suspensi dari sel darah yang di cuci bersih dalam plate. Putar plate dan lihat aglutinasi setelah 1 menit. Cairan alantois yang terinfeksi dipanen setelah 1-4 hari inokulasi. Untuk mencegah darah dalam cairan, embrio disimpan semalam dalam suhu 4ºC kemudian injeksi kerabang dekat rongga udara dan buka kerabang tersebut dengan pinset steril. Membran ditekan ke atas yolk sac dan cairan diambil dengan spuit dan dimasukkan ke dalam cawan petri. terkontaminasi

bakteri.

Kultur cairan tersebut Contoh

virus

yang

untuk

menghindari

diinokulasikan

pada

chorioalantois ini antara lain, virus ND dan virus influenza (Nayak, 2012).

cairan ruang

Inokulasi pada membran chorioalantois pada embrio umur 10-11 hari adalah yang paling cocok. Telur diletakkan horizontal di atas tempat telur. Desinfektan kerabang disekitar ruang udara dan daerah lain di atas embrio telur. Buat lubang pada daerah tersebut dan diperdalam lagi hingga mencari membran kerabang (Fournier, 2012). Virus diinokulasikan pada membran korioalantois dan lubang ditutup dengan lilin dan diinkubasi. Setelah 3-6 hari korioalantois membran yang terinfeksi dapat di panen dengan mengeluarkan yolk sac dan embrio secara hati-hati tanpa membuat membran lepas dari kerabang. Area inokulasi dapat di lihat dengan adanya lesi pada CAM sebelum dilepas dari kerabang. Inokulasi pada yolk sac dilakukan pada embrio umur 5-7 hari. Post inokulasi diinkubasi selama 10 hari. Virus diinokulasikan pada bagian yolk sack dan dijaga jangan sampai terkontaminasi bakteri. Virus yang biasa diinokulasikan di bagian ini adalah virus rabies (Nayak, 2012). Inokulasi virus dengan metode In Vitro dilakukan dengan menanam virus pada kultur jaringan. Kultur jaringan virus dimulai dengan kultivasi embrio anak ayam cincang didalam serum atau larutan-larutan garam. Bila sel-sel hewan dikulturkan di wadah-wadah plastik atau kaca, maka sel-sel tersebut akan melekatkan dirinya pada permukan wadah itu dan terus-menerus membelah diri sampai seluruh daerah permukaan yang tertutupi medium terisi, maka terbentuklah suatu lapisan tunggal sel dan dipergunakan untuk mengembangkan virus. Sel-sel jaringan yang berbeda-beda lebih efektif untuk kultivasi beberapa virus ketimbang yang lain. Pendekatan ini telah memungkinkan kultivasi banyak virus sebagai biakan murni dalam jumlah besar untuk penelitian dan untuk produksi vaksin secara komersial. Juga luas penggunaannya untuk isolasi dan perbanyakan virus dari bahan klinis. Vaksin yang disiapkan dari kultur jaringan mempunyai keuntungan dibandingkan dengan yang disiapkan dari telur ayam berembrio

dalam

hal

mengurangi

kemungkinan

seorang

pasien

untuk

mengembangkan hipersensitivitas atau alergi terhadap albumin telur (Manz, 2013). Virus dapat ditanam pada hewan laboratorium yang peka. Metodein vivo merupakan metode yang pertama kali dalam menanam virus. Metode ini

dapat digunakan untuk membedakan virus yang dapat menimbulkan lesi yang hampir mirip misalnya FMDP atau Vesikular Stomatitis pada sapi. Hewan laboratorium yang digunakan antara lain mencit, tikus putih, kelinci ataupun marmut (Merchant and Packer, 1956). Telur ayam berembrio telah lama merupakan sistem yang telah digunakan secara luas untuk isolasi. Embrio dan membran pendukungnya menyediakan keragaman tipe sel yang dibutuhkan untuk kultur berbagai tipe virus yang berbeda. Membran kulit telur yang fibrinous terdapat di bawah kerabang. Membran membatasi seluruh permukaan dalam telur dan membentuk rongga udara pada sisi tumpul telur. Membran kulit telur bersama dengan cangkang telur membantu mempertahankan intregitas mikrobiologi dari telur, sementara terjadinya difusi gas kedalam dan keluar telur. Distribusi gas di dalam telur dibantu dengan pembentukan CAM yang sangat vaskuler yang berfungsi sebagai organ respirasi embrio (Purchase, 1989). Mekanisme infeksi diawali oleh protein HN. Protein HN berperan dalam tahap penempelan virus ND pada reseptor sel inang atau induk semang yang mengandung sialic acid. Molekul sialic acid ini adalah glycoprotein dan glycolipid. Penempelan virus dilakukan dengan penyatuan virus dan membran sel yang diperantarai oleh protein F. Virus RNA kemudian dilepaskan dalam sitoplasma dan terjadi replikasi. Envelope virus masuk ke dalam sel melalui 2 jalan utama yaitu pertama, penyatuan secara langsung antara envelope virus dengan membran plasma dan kedua, diperantarai oleh reseptor endositosis. Penetrasi virus melalui reseptor endositosis tergantung p ada kondisi pHnya. Pada paramyxoviruses, proses penyatuan membran virus dengan membran plasma inang atau induk semang tidak tergantung pH. Walaupun

demikian,

hasil

penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa penyatuan virus ND dengan sel mampu meningkatkan pH. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa penetrasi virus ND pada sel inang melalui reseptor endositosis juga dipengaruhi oleh kondisi Ph (Hewajuli, 2011). Penularan penyakit tetelo dari satu hewan ke hewan lainnya melalui kontak, dengan hewan sakit, skeresi, ekskresi dari hewan sakit serta bangkai hewan penderita tetelo. Jalan penularan melalui alat pencernaan dan pernafasan,

virus yang tercampur lendir atau virus yang ada dalam feses dan urine tahan dua bulan bahkan dalam keadaan kering tahan lebih lama lagi. Demikian pula virus yang mencemari litter (jejabah) dan perlengkapan kandang. Hal ini merupakan sumber penularan yang penting (Balai Penyuluhan Pertanian, 2010). Penyebaran penyakit ini biasanya melalui kontak langsung dengan ayam yang sakit dan kotorannya, melalui ransum, air minum, kandang, tempat ransum atau minum, peralatan lainnya yang tercemar oleh kuman penyakit, melalui pengunjung, serangga, burung liar dan angin/udara (dapat mencapai radius 5 km). Virus ND ditemukan dalam jumlah tinggi selama masa inkubasi sampai masa kesembuhan. Virus ini terdapat pada udara yang keluar dari pernafasan ayam, kotoran, telurtelur yang diproduksi selama gejala klinis dan dalam karkas selama infeksi akut sampai kematian (Papaji, 2011). Wabah tetelo umumnya terjadi karena perubahan dari induknya sendiri, seperti kenaikan jumlah populasi yang tidak kebal, perubahan iklim yang menyebabkan stress seperti perubahan musim kemarau kemusim hujan atau sebaliknya dan makanan kurang baik atau keadaan lingkungan yang memungkinkan penularan itu terjadi seperti sanitasi dan tatalaksana yang kurang baik (Balai Penyuluhan Pertanian, 2010). Penularan dari satu tempat ketempat lain terjadi melalui alat transportasi, pekerja kandang, burung dan hewan lain, debu kandang, angin, serangga, makanan dan karung makanan yang tercemar. Dapat pula melalui transportasi dari karkas ayam yang tertular tetelo dan ayam dalam masa inkubasi. Wabah tetelo ditandai dengan mortalitas dan morbiditas tinggi. Kematian oleh strainvelogenik type Asia paling tinggi 80-100%, strain velogenik type Amerika 60-80%, strain mesogenikbiasanya tidak melebihi 10% dan tiu terbatas pada ayam-ayam yang muda. Strain lentogenikakhir-akhir ini dilaporkan banyak ditemui dialam bebas, menyebabkan infeksi yang asymptomatis (Balai Penyuluhan Pertanian, 2010).

V. KESIMPULAN DAN DARAN A. Kesimpulan

Berdasarkan hasil dan pembahasan di atas, maka dapat diambil kesimpulan sebagai berikut: 1. Ada tiga cara perkembangbiakan virus yaitu dengan hewan percobaan (in vivo), cara kultur jaringan (in vitro) dan telur bertunas (in ovo). 2. Cara pembiakan virus pada telur berembrio dapat melalui penyuntikan pada lapisan luar selaput korioalantois, ruang amnion dan kantung kuning telur. 3. Embrio yang terinokulasi virus akan mengalami lesi pada CAM seperti edema atau perkembangan plak karena adanya hemaglutinasi, pada buku-buku kaki akan menjadi berwarna kehijauan, perkembangan otot yang abnormal, organ visceral yang abnormal, tubuh sangat lunak dan mengalami kematian. B. Saran Saran untuk praktikum ini adalah hendaknya telur yang dipakai untuk praktikum umurnya sama dan berasal dari induk yang sama yaitu dengan cara memesan terlebih dahulu dua minggu sebelumnya ke peternakan atau warga yang memelihara ayam, agar dapat dengan mudah dibandingkan dengan kontrol.

VI.

LATIHAN PEMAHAMAN 1. Keberhasilan dalam mengisolasi dan mengembangkan virus pada telur ayam berembrio tergantung pada beberapa kondisi yaitu... Jawab : rute inokulasi, umur embrio, temperatur inkubasi, waktu inkubasi setelah inokulasi, volume dan pengenceran dari inokulum yang digunakan, status imun dari kelompok dimana telur ayam berada. 2. Newcastle

Disease

Virus

(NDV)

apabila

berada

berada

pada

chorioalantois maka akan mengalami tiga tahap perkembangan virus. Jelaskan 3 tahap perkembangan tersebut! Jawab : Tahap pertama ditandai dengan dimulainya hipertrofi, hiperplasia sel dan kehadiran dari sedikit badan inklusi sitoplasma yang biasanya ditemukan dalam sel. Tahap 2, juxtanuclear agregat nukleokapsid-

glikogen muncul dan ada peningkatan jumlah mikrovili. Tahap 3 yang ditandai dengan peningkatan kepadatan sitoplasma, perakitan virus dan pelepasa. 3. Bagaimana cara penularan penyakit tetelo yang disebabkan oleh Newcastle Disease Virus ini? Jawab : Penularan penyakit tetelo dari satu hewan ke hewan lainnya melalui kontak, dengan hewan sakit, skeresi, ekskresi dari hewan sakit serta bangkai hewan penderita tetelo. Jalan penularan melalui alat pencernaan dan pernafasan, virus yang tercampur lendir atau virus yang ada dalam feses dan urine tahan dua bulan bahkan dalam keadaan kering tahan lebih lama lagi

GLOSARIUM

1. Elusi: proses ekstraksi suatu bahan dari bahan lainnya dengan cara mencuci menggunakan pelarut. 2. Hemaglutinasi: penggumpalan sel-sel darah merah. 3. Inokulasi: kegiatan pemindahan mikroorganisme dari tempat atau sumber asalnya ke medium baru yang telah dibuat dengan tingkat ketelitian yang sangat tinggi dan aspetis. 4. Isolasi: proses pemindahan atau pemisahan mikroorganisme dari lingkungan alam bebas untuk menumbuhkannya di suatu Medium buatan agar diperoleh biakan murni. 5. Paramyxoviridae: keluarga virus yang memiliki genom rna utas negatif dan tidak bersegmen. 6. Penetrasi: penembusan, penerobosan atau perembesan. 7. Pleomorfik: berbentuk tidak teratur. 8. Replikasi: proses penggandaan. 9. Virulensi: kapasitas relatif patogen untuk mengatasi pertahanan tubuh.

BAGIAN 2

SUB TOPIK / SUB JUDUL

: Virus RNA

TUJUAN INTRUKSIONAL

: Mampu melakukan pemeriksaan secara serologis terhadap infeksi virus.

INDIKATOR

: Kemampuan melakukan identifikasi dan laporan hasil praktikum.

URAIAN MATERI

:

1. Berikut Uraian Beberapa Klasifikasi Virus 1. Klasifikasi virus berdasarkan morfologi Berdasarkan morfologi, virus dibagi berdasarkan jenis asam nukleat dan juga protein membran terluarnya (sampul) menjadi 4 kelompok, yaitu: 1. Virus DNA 2. Virus RNA 3. Virus berselubung 4. Virus tidak berselubung Virus hanya mengandung satu jenis asam nukleat: DNA atau RNA.

2. Klasifikasi virus berdasarkan tropisme dan cara penyebaran Berdasarkan tropisme dan cara penyebaran, virus dibagi menjadi: 1. Virus Enterik 2. Virus Respirasi 3. Arbovirus 4. Virus onkogenik 5. Hepatitis virus

3. Klasifikasi virus berdasarkan genomik fungsional Virus diklasifikan menjadi 7 kelompok berdasarkan alur fungsi genomnya. Klasifikasi ini disebut juga klasifikasi Baltimore yaitu:

1. Virus tipe I: DNA utas ganda 2. Virus tipe II = DNA utas tunggal 3. Virus tipe III = RNA utas ganda 4. Virus tipe IV = RNA utas tunggal (+) 5. Virus tipe V = RNA utas tunggal (-) 6. Virus tipe VI = RNA utas tunggal (+) dengan DNA perantara (intermediat) 7. Virus tipe VII = DNA utas ganda dengan RNA perantara

VIRUS RNA

Pengertian Virus RNA Virus RNA adalah virus yang materi genetiknya berupa asam nukleat yang berbentuk rantai tunggal atau ganda tidak berpilin. Di dalam sel inangnya, RNA pada virus akan mengalami transkripsi balik menjadi Hibrid RNA-DNA dan akhirnya membentuk DNA. Selanjutnya DNA virus akan masuk ke inti sel inangnya, menyisip ke dalam DNA inangnya. DNA virus akan merusak DNA inangnya dan membentuk mRNA. mRNA akan mengalami translasi untuk menghasilkan protein selubung virus untuk menbentuk virus – virus baru .

Perbedaan Virus DNA dengan Virus RNA 1. DNA virus sebagian besar beruntai ganda sedangkan virus RNA beruntai tunggal. 2. Tingkat mutasi RNA lebih tinggi dari laju mutasi DNA. 3. Replikasi DNA terjadi pada inti sementara replikasi RNA terjadi dalam sitoplasma. 4. Virus DNA lebih stabil sementara virus RNA tidak stabil. 5. Pada virus DNA, kode genetik virus disuntikkan dalam DNA inang untuk duplikasi dan decoding. RNA virus melewatkan DNA untuk duplikasi dan decoding. 6. Perbedaan utama antara kedua jenis virus ini adalah bahwa virus RNA memiliki RNA dalam genom mereka sementara virus DNA memiliki DNA dalam genom mereka. Baik DNA dan RNA tidak dapat ditemukan dalam virus yang sama.

7. Virus RNA pertama mengadsorbsi ke permukaan sel inang. Kemudian virus melekat dan menyatu dengan membran endosome. Akhirnya sebagai akibat dari fusi dari virus, nukleokapsid dilepaskan ke dalam sitoplasma. Tidak seperti virus RNA, virus DNA melewatkan DNA mereka ke dalam inti sel inang, bukan ke dalam sitoplasma sel inang. 8. Enzim polimerase DNA yang digunakan dalam proses replikasi virus DNA. Karena DNA polimerase memiliki aktivitas penyaringan, tingkat mutasi lebih rendah pada virus DNA. RNA polimerase digunakan dalam proses replikasi RNA virus RNA. Tingkat mutasi tinggi dalam virus RNA karena RNA polimerase tidak stabil dan dapat menyebabkan kesalahan selama replikasi. 9. Dalam virus DNA, ada dua tahap dalam proses transkripsi yaitu awal dan akhir transkripsi. Pada tahap awal, mRNA yang dibuat (alpha dan beta mRNA). Pada tahap akhir, mRNA gamma dibuat dan diterjemahkan ke dalam sitoplasma. Fase akhir terjadi setelah replikasi DNA. Fase ini tidak dapat dibedakan dalam proses transkripsi RNA dalam virus RNA. Virus RNA menerjemahkan mRNA pada ribosom inang dan membuat semua lima protein virus sekaligus. 10.Replikasi RNA virus RNA biasanya terjadi dalam sitoplasma sel inang sementara replikasi DNA virus DNA terjadi di dalam inti sel inang.

Klasifikasi Virus Rna Virus RNA diklasifikasikan menjadi Orthomyxoviruses, Paramyxoviruses, Rhabdoviruses, Picornaviruses, Togaviruses, Reoviruses dan Retroviruses.

Gambar 1 Virus RNA

Famili 1.

Picornaviridae

Sifat Penting Dan Uraian RNA

:

rantai

tunggal,replikasi

panjang,polaritas

RNA

melalui

positif,segmen

pembentukan

RNA

komplementer yang bertindak sebagai cetakan sintesis RNA genom. Gambar 2 Picornaviridae

Virion : tidak berselubung,bentuk ikosahedral,tersusun atas empat jenis protein utama. Diameter virion 28-30 nm. (picos =kecil) Replikasi dan morfologis virus terjadi di sitoplasma Spektrum hospes sempit. Genus Pikornavirus. Kelompok yang menginfeksi manusia adalah rinovirus (lebih dari

100

serotipe

yang

menyebabkan

selesma)

dan

enterovirus(polio-,coksaki-,dan ekovirus). Rinovirus bersifat tak tahan asam dan mempunyai kerapatan tinggi,enterovirus bersifat tahan asam dan kerapatan lebih randah. Contoh penyakit : Pilek, penyakit kuku dan mulut pada ternak sapi dan ensefalomiokarditis pada hewan pengerat. 3.

Togaviridae

RNA: rt,polaritas positif,segmen tunggal,replikasi RNA melalui pembentukan RNA komplementer yang bertindak sebagai cetakan RNA genom.

Gambar 3 Togaviridae

Virion

:

berselubung,nukleokapsid

berbentuk

ikosahedral,tersusun atas tiga sampai empat jenis protein utama. Protein selubung mempunyai aktivitas hemaglutinasi.

Diameter 60-70 nm. Replikasi di sitoplasma dan morfogenesis melalui proses budding di membaran sel. Spektrum hospes luas. Genus Togavirus. Togavirus ,banyak arbovirus yang merupakan patogen utama pada manusia,termasuk virus rubela. Virus ini mempunyai selubung yang mengandung lemak dan bersifat peka terhadap eter. Contoh Penyakit : Rubella 5.

Bunyaviridae

RNA: rt,polaritas negatif,terdiri dari tiga segmen. Pada replikasinya, RNA virion disalin menjadi mRNA dengan bantuan transkriptasa virion. Dengan bantuan produk translasi mRNA selanjutnya disintensis RNA komplementer.

Gambar 4 Bunyaviridae

Setiap segmen RNA komplementer kemudian menjadi cetakan bagi RNA genom. Virion :berselubung, nukleokapsid berbentuk heliks,tersusun atas empat protein utama. Protein selubung mempunyai aktivitas hemaglutinasi. Diameter virion 90-120 nm Replikasi terjadi di sitoplasma dan morfogenesisnya melalui proses budding di membran sel Spektrum hospes luas. Genus Bunyavirus. Sebagian besar virus ini ditularkan pada vertebrata melalui arthropoda (arbovirus). Sekitar 70 jenis secara antigenik berhubungan dengan virus Bunyamwera. Hantavirus tidak ditularkan oleh arthropoda tetapi oleh hewan pengerat.

Contoh penyakit : virus ini menyebabkan demam hemoragik dan nefropati,seperti sidroma paru yang berat. 6.

Arenaviridae

RNA: rt,polaritas negatif,terjadi dari dua segmen. Prinsip replikasi RNA-nya sama dengan Bunyaviridae Virion : berselubung, nukleokapsid berbentuk heliks,tersusun atas tiga protein utama.bentuk virion pleomorfik. Diameter virion 50-300 nm(rata-rata 110-130 nm)

Gambar 5 Arenaviridae

Replikasi terjadi di sitoplasma dan morfogenesisnya melalui proses budding di membran sel Spektrum hospes luas. Genus Arenavirus. Sebagian besar anggota famili ini bersifat unik untuk daerah Amerika tropis(kompleks Tacaribe). Semua Arenavirus yang patogen terhadap manusia juga menyebabkan infeksi kronis pada hewan pengerat. Contohnya virus demam Lassa Afrika Contoh penyakit : Meningitis

7.

Coronaviridae

RNA: rt,polaritas positif,terdiri dari satu segmen. Replikasi RNA genom melalui pembentukan rantai RNA negatif yang kemudian bertindak sebagai cetakan bagi RNA genom. Sintesis RNA negatif disertai sintensis enam jenis mRNA. Virion :berselubung,nukleokapsid berbentuk heliks,tersusun

Gambar 6 coronaviridae

atas tiga protein utama. Virion bentuk pleomorfik. Diameter panjang virion 80-160 nm Replikasi terjadi di sitoplasma dan morfogenesisnya melalui proses budding di membran intrasitoplasma. Genus Koronavirus.

Koronavirus manusia telah diisolasi dari penyakit-penyakit saluran pernapasan bagian atas akut yaitu selesma. Torovirus yang menyebabkan gastroenteritis,berasal dari genus yang berbeda dari famili koronavirus. Koronavirus hewan dapat menyebabkan infeksi menetap dan mencakup virus bronkitis menular pada burung. Contoh penyakit : SARS 8.

Rhabdoviridae

RNA: rt,polaritas negatif,satu segmen. Prinsip replikasi RNA-nya sama dengan Bunyaviridae Virion :berselubung,nukleokapsid berbentuk heliks,tersusun atas empat sampai lima protein.

Gambar 7 Rabdoviridaea

Virion berbentuk seperti peluru dengan selubung beraktivitas hemaglutinasi. Diameter panjang virion 70-85 nm dan 130180 nm Replikasi terjadi di sitoplasma dan morfogenesisnya melalui di membran sel atau membran intrasitoplasma,tergantung spesies virus. Genus Rhabdovirus . Anggota kelompok ini adalah virus rabies Contoh Penyakit : Rabies

10. Paramyxoviridae

RNA: rt,polaritas negatif,segmen tunggal. Replikasi RNA dimulai dengan sintesa dengan bantuan transkriptasa virion. Dengan bantuan produk protein mRNA dibuat RNA cetakan RNA genom Virion : tidak berselubung,berbentuk ikosahedral,tersusun

Gambar 8 Paramyxoviridae

atas tiga jenis protien utama. Diameter virion 35-45 nm.

Replikasi dan morfogenesis di sitoplasma. Spektrum hospes sempit. Genus Paramyksovirus. Virus-virus

yang

menginfeksi

gondong,campak,virus

manusia

parainfluenza,dan

antara virus

lain

sinsitial

pernapasan. Berbeda dengan virus influenza,paramiksovirus secara genetik bersifat stabil Contoh penyakit : Campak, gondongan. 11. Orthomyxoviridae

RNA: rt,segmen berganda (7 untuk influenza C dan 8 untuk influenza A dan B),polarisatas negatif. Replikasi RNA dimulai dengan sintesis mRNA dengan bantuan transkriptasa virion. Dengan bantuan protein produk mRNA.

Gambar 9 Orthomyxovirus

RNA komplementer dibuat dan dijadikan cetakan untuk pembuatan RNA genom. Virion : berselubung,nukleokapsid helik ,tersusun atas 7-9 jenis protien utama. Virion berbentuk pleomorfik. Selubung mempunyai aktivitas hemaglutinasi Diameter virion 90-120 nm. Pada yang filamenntosa panjangnya dapat mencapai beberapa mikrometer. Replikasi

RNA

terjadi

di

inti

dan

sitoplasma

dan

morfogenesis terjadi melalui proses budding di membran plasma. Genus Ortomiksovirus Semua ortomiksovirus merupakan virus influenza yang menginfeksi manusia atau hewan. Sifat genom virus yang bersegmen memungkinkan penyusunan ulang genetik secara cepat bila virus dua virus influenza menginfeksi sel yang

sama,hal ini menerangkan tingginya laju variasi alami virusvirus influenza. Contoh penyakit : Influenza 12. Reoviridae

RNA: rantai ganda, segmen berganda(10 untuk reovirus dan orbivirus,11 untuk rotavirus,12 untuk colorado tick fever virus. Setiap mRNA berasal dari satu segmen genom. Sebagian mRNA dipakai untuk sintensis protein dan sebagian lagi dipakai sebagai cetakan untuk pembuatan rantai RNA pasangannya. Virion : tak berselubung,kapsidnya dua lapis dan bersimetri ikosahedral. Diameter virion 60-80 nm. Replikasi dan morfogenesis di sitoplasma. Genus Reovirus . Reovirus manusia mencakup rotavirus yang menyebabkan gastoenteritis pada anak-anak dan berbentuk seperti roda. Reovirus yang serupa secara antigenik menginfeksi banyak hewan. Orbivirus merupakan suatu subkelompok khusus yang mencakup virus ditularkan arthropoda yang menginfeksi serangga dan hewan(seperti lidah biru ternak sapi dan biri-biri). Genus Coltivirus meliputi virus demam sengkenit Colorado pada manusia.

13. Retroviridae

RNA: rt,terdiri dari dua molekul polaritas negatif yang identik. Replikasi dimulai dengan pemisahan kedua molekul RNA dan pembuatan rantai DNA dengan cetakan RNA tersebut dengan bantuan reverse transcriptase virion. Setelah molekul RNA-DNA terpisah,dibuat rantai DNA komplementer terhadap pasangan DNA yang sudah ada. DNA serat ganda

kemudian mengalami sirkularisasi dan berintegrasi dengan kromosom hospes. Selanjutnya RNA genom dibuat dengan cetakan DNA yang sudah terintegrasi pada kromoson hospes. Virion : berselubung,simetri kapsid ikosahedral. Virion tersusun atas tujuh jenis protein utama. Diameter virion 80-130 nm. Morfogenesis virus terjadi melalui proses budding di membaran plasma. Genus Retrovirus Virus bereplikasi dari salinan DNA “provirus” di dalam sel yang terinfeksi. Inang tetap terinfeksi secara kronis. Leukemia dan virus sarkoma hewan dan manusia,virus busa pada primata dan beberapa virus “lambat” yang disebut lentivirus (visna,penyakit maedi pada biri-biri) termasuk pada kelompok ini. Contoh penyakit : Retrovirus berhubungan dengan sindroma imunodefisiensi didapat (AIDS). Keterangan: rt= rantai tunggal,rg = rantai ganda.

Penyakit Berdasarkan sumber penularannya, penyakit yang disebabkan oleh virus dapat digolongkan kedalam empat macam, yaitu :penyakit yang ditularkan melalui udara, penyakit yang ditularkan melalui air, penyakit yang ditularkan melalui hubungan kelamin,dan penyakit yang ditularkan melalui hewan. a. Penyakit yang ditularkan melalui udara : 1) Pilek Pilek merupakan penyakit yang umum diderita oleh anak-anak maupun orang dewasa. Gejala yang diderita meliputi kelelahan, dan banyaknya lendir yang

keluar dari hidung. Penyakit ini disebabkan oleh Rhinovirus (virus RNA rantai tunggal). Dari hasil penelitian diketahui bahwa terdapat 100 macam rhinovirus dengan serotipe yang berbeda. Virus-virus lain seperti adenovirus dan orthomyxovirus juga penyebab dari 10% penyakit pilek. 2) Influenza Influenza disebabkan oleh Orthomyxovirus (virus RNA). Virus ini ditularkan dari orang ke orang melalui udara, terutama dari cipratan pada saat batuk atau bersin. Virus ini kemudian menginfeksi membran mukosa saluran pernafasan atas dan kadang-kadang masuk ke dalam paru-paru. Gejala yang diderita biasanya demam ringan dari 3-7 hari, dingin, lesu, pegal linu dan sakit kepala. Gejala yang lebih berat biasanya bukan disebabkan oleh virus influenza, namun infeksi sekunder yang disebabkan oleh bakteri yang masuk kedalam penderita ketika kekuatan tubuhnya mulai melemah akibat influenza yang dideritanya. 3) Campak Campak merupakan penyakit yang biasanya menyerang anak-anak. Penyakit ini ditandai dengan gejala-gejala pilek, mata merah, batuk dan panas. Penyebab campak adalah paramxovirus yang masuk melalui hidung dan tenggorokan dari udara dan secara cepat menyebar ke seluruh tubuh. Masa inkubasi penyakit campak adalah 7 – 10 hari. Komplikasi dari campak yang sering

terjadi

adalah

infeksi

telinga,

pneumonia

dan

campak

enchephalomielitis (jarang terjadi). Namun apabila enchepalomielitis terjadi maka dapat menyebabkan gangguan pada sistem syaraf salah satu bentuk dari epilepsi. Campak enchepalomielitis merupakan penyakit yang sangat berbahaya pada anak-anak dan menjadi salah satu penyebab kematian anak. 4) Gondongan Gondongan disebabkan oleh paramyxovirus dengan tipe yang berbeda dari paramyxovirus penyebab penyakit campak. Penyakit ini diedarkan melalui cipratan yang ditularkan melalui udara yang kemudian mengalir dalam aliran darah. Penyakit gondogan ditandai dengan membengkaknya kelenjar ludah

yang menyebabkan pembekakan pada rahang dan leher. Virus yang menyebar melalui aliran darah ini dapat memasuki organ lain seperti otak, testes dan pankreas. 5) SARS (Severe acute respiratory syndrome) SARS merupakan penyakit yang ditularkan melalui udara akibat cipratan dahak atau bersin orang yang mengidap penyakit tersebut. Penyakit ini menyerang saluran pernafasan,, terutama bagian paru-paru. Awalnya belum diketahui apa penyebab serangan dadakan infeksi paru-paru ini, sehingga terkesan sebagai penyakit misterius, yang tidak jelas identitas penyebabnya. Para ahli mikrobiologi menemukan virus penyebabnya penyakit tersebut dengan mengisolasi virus dari dahak pasien ternyata virus keluarga paramyxoviridae yaitu corona virus. Virus ini berkerabat dengan penyebab campak,gondongan dan influenza. 6) Flu burung Flu burung merupakan penyakit yang disebabkan oleh virus H5N1 (H= Hemaglutinin, N = Neuramidase). Virus ini biasanya menyerang hewan unggas yang kemudian dapat menginfeksi manusia. Gejala-gejalanya mirip dengan influenza disertai muncul gejala sesak pernafasan. 7) Rubella Rubella atau campak Jerman adalah penyakit yang disebabkan suatu virus RNA dari golongan Togavirus. Penyakit ini relatif tidak berbahaya dengan morbiditas dan mortalitas yang rendah pada manusia normal. Tetapi jika infeksi didapat saat kehamilan, dapat menyebabkan gangguan pada pembentukan organ dan dapat mengakibatkan kecacatan.

b. Penyakit yang ditularkan melalui hubungan kelamin 1) AIDS (Acquired Immuno-Deficiency Syndrome)

Penyakit ini dikenali pertama kali pada tahun 1981. Sejak saat itu penyakit AIDS banyak mendapat perhatian dunia. Pengobatan untuk penyakit ini sampai saat ini masih dalam tahap penelitian. AIDS disebabkan oleh virus HIV (human immunodeficiency virus) yang merupakan kelompok retrovirus. Virus ini memiliki enzim reverse transkriptase yang menggunakan RNA sebagai cetakan yang kemudian diubah menjadi DNA. Dengan demikian virus ini dapat berintegrasi dengan DNA inang. Jenis sel inang yang diserang oleh HIV adalah sel T limposit, sehingga fungsi normal T limposit sebagai sistem imun menjadi terganggu. Akibat terserang system imun maka akan menimbulkan infeksi yang kompleks yang mengakibatkan kematian pada penderita.

c. Penyakit yang ditularkan melalui hewan (zoonoses) 1) Rabies Rabies disebabkan oleh virus dari kelompok rhabdovirus (Virus RNA). Virus ini dapat ditularkan pada manusia melalui gigitan hewan peliharaan yang menderita rabies seperti misalnya kucing, anjing dan monyet. Virus rabies menyerang sistem syaraf pusat hewan berdarah panas dan pada umumnya mengakibatkan kematian apabila tidak diobati. 2) Demam berdarah Penyakit ini ditularkan melalui gigitan serangga, yaitu sejenis nyamuk Aedes aegepty. Penyakit ini disebabkan oleh virus dengue. Gejala penyakit ini biasanya timbul demam tinggi dan terdapat bercak-bercak merah pada permukaan kulit penderita.

d. Penyakit yang ditularkan melalui makanan 1) Hepatitis A

Virus hepatitis A adalah picornavirus dengan genom berupa RNA positif utas tunggal yang berbentuk linear. Virus ini tidak memiliki selubung. Transmisi penyebaran virus ini adalah melalui jalur feses dan oral, sedangkan tempat replikasinya adalah pada sel-sel hati. Hepatitis A menyebar dari usus melalui aliran darah menuju hati dan mengakibatkan kulit dan mata berwarna kekuning-kuningan, air senin berwarna coklat akibat produksi getah empedu yang dihasilkan oleh hati yang terinfeksi virus ini tidak normal. Jenis makanan yang dapat menularkan virus ini adalah kerang yang diambil dari perairan yang tercemari feses. Pencegahan infeksi dapat dilakukan dengan menjaga kebersihan dan telah tersedia vaksinasi untuk virus ini.

PROSEDUR PEMERIKSAAN 1. PEMERIKSAAN HIV A. Pemeriksaan Serologi -

Metode : Imunokromatografi (Rapid Test)

-

Tujuan : Mendeteksi keberadaan virus HIV atau antibod HIV dalam sampel Serum.

-

Prinsip : Specimen yang di teteskan pada ruang membrane bereaksi dengan partikel yang telah dilapisi dengan protein A yang terdapat pada bantalan specimen. Selanjutnya akan brgerak secara kromatografi dan bereaksi dengan antigen HIV rekombinan yang terdapat pada garis test. Jika specimen mengandung antibody HIV maka akan timbul garis warna.

-

Dasar Teori: HIV adalah suatu virus yang dapat menyebabkan penyakit AIDS. Virus ini menyerang manusia dan menyerang sistem kekebalan (imunitas) tubuh, sehingga tubuh menjadi lemah dalam melawaninfeksi. Seperti virus lain pada umumnya, HIV hanya dapat bereplikasi dengan memanfaatkan sel inang. Siklus hidup HIV diawali dengan penempelan partikel virus (virion) dengan reseptor pada permukaan sel inang, di antaranya adalah CD4, CXCR5, dan CXCR5. Selsel yang menjadi target HIV adalah sel dendritik, sel T, dan makrofaga. Sel-sel tersebut terdapat pada permukaan lapisan kulit dalam (mukosa) penis,vagina,

dan oral yang biasanya menjadi tempat awal infeksi HIV. Selain itu, HIV juga dapat langsung masuk ke aliran darah dan masuk serta bereplikasi di noda limpa. -

Alat dan Bahan: Alat

: - Strip HIV/Test card HIV - Pipet tetes -Tabung reaksi kecil + rak

Bahan

: - Sampel serum - Sampel dilution buffer

-

Cara Kerja : 1.

Disiapkan alat dan bahan yang akan digunakan.

2.

Dimasukkan 3 tetes serum pada sumur sampel.

3.

Ditambahkan 1 tetes larutan buffer.

4.

Didiamkan selama beberapa menit.

5.

Dibaca reaksi yang terjadi.

B. PEMERIKSAAN ELISA -

Mekanisme : 1. Virus HIV ditumbuhkan pada biakan sel 2.

Dirusak dan dilekatkan pada biji-bijin polistiren atau sumur microplate\

3. Inkubasi serum atau plasma yang akan diperiksa dengan antigen tersebut selama 30 menit sampai 2 jam, lalu cuci 4.

Bila positif IgG(immunoglobulin G) yg menempel pada biji2 / sumur microplate, maka akan terjadi reaksi pengikatan antigen-antibodi ; antibodi

anti-IgG

sudah

diberi

fosfatase, horseradish peroxidase

label

dengan

enzim

alkali

2. PEMERIKSAAN VIRUS INFLUENZA -

Metode: Hemaglutinasi

-

Tujuan: 1. Mengetahui titer tertinggi yang masih bisa menyebabkan hemaglutinasi secara total. 2. Menentukan kekuatan antigen (virus).

-

Prinsip: virus infleunza + eritrosit 0,5% => virus diikat dengan reseptor eritrosit antigen + eritrosit 0,5% => hemaglutinasi

-

Dasar Teori: Hemaglutinasi adalah daya pengikatan antigen virus dengan eritrosit hewan tertentu, karena virus diikat oleh reseptor eritrosit. Bila virus diikat oleh eritrosit beberapa jenis virus, dilepaskan kembali secara spontan oleh eritrosit yang mengikat virus sehingga terjadi elusi. Sesudah terjadi elusi, virus dilepaskan dan virus masih bisa mengadakan hemaglutinasi dengan eritrosit lain, tetapi eritrosit yang telah dilepaskan virus tidak bisa mengikat virus lain, sebab reseptor eritrositnya sudah rusak oleh virus yang pertama. Bila HA (+), berarti virus diikat oleh anti serum yang sesuai. Hemaglutinasi terjadi dalam 3 tahap, yaitu; 1. Absorbsi virus pada reseptor virus 2. Aglutinasi dari virus eritrosit kompleks 3. Elusi virus secara spontan

Salah satu virus yang bisa mengadakan hemaglutinasi dengan berbagai jenis eritrosit adalah virus influenza, yaitu bila virus baru diisolasi dari penderita, ditanam intra amnion dan bila mengadakan hemaglutinasi golongan O atau dengan

eritrosit

cavia.

Untuk menentukan kekuatan antigen virus dapat dilakukan dengan pemeriksaan

hemaglutinasi,

yaitu

dengan

titer

hemaglutinasi

(IUHA).

Titer hemaglutinasi IUHA, yaitu pengenceran virus tertinggi yang dapat menyebabkanhemaglutinasi total. Semakin tinggi pengenceran virus maka akan semakin kecil kekuatan virus untuk menyebabkan HA total.

- Alat dan Bahan :

Alat: - tabung reaksi - rak tabung - pipet ukur 1 ml

Bahan : - cairan alantois - NaCl 0,85% - eritrosit golongan O 0,05%

- Cara Kerja :

1. Disiapkan alat dan bahan yang dibutuhkan. 2. Dilakukan pengenceran sebagai berikut

Pengenceran

1/2

1/4

1/8

1/16

1/32

1/64

1/128

1/256

1/512

CE

NaCl 0,85%

0,2

0,2

0,2

0,2

0,2

0,2

0,2

0,2

0,2

0,4

Cairan

0,2

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

0,4

(ml)

Alantois Eritrosit GolonganO 0,05%

3.Dikocok,dihomogenkan. 4. Disimpan pada suhu kamar selama 45 menit. 5.Diamati hasilnya, hasil positif aglutinasi berkumpul menyerupai titik, hasil negatif tidak terjadi aglutinasi, hasil postif negatif aglutinasi berkumpul menyerupai titik tapi disekitarnya masih terlihat bercak.

3. PEMERIKSAAN RUBELLA Anti Rubella IgG dan IgM 

Tujuan: Untuk mendeteksi adanya antibodi IgG dan IgM terhadap virus Rubella dalam serum atau plasma manusia.



Prinsip : Kombinasi dari metode imunoenzim dan imunocapture dengan hasil akhir dibaca menggunakan flourence (ELFA). SPR (Solid Phase Receptacle) berfungsi sebagai pemipet cairan dalam pemeriksaan. Reagent yang digunakan adalah reagent siap pakai yang dikemas dalam bentuk strip yang tertutup rapat. Semua proses pemeriksaan dilakukan secara otomatis didalam alat, proses reaksi medium dilakukan beberapa waktu didalam dan diluar SPR.



Dasar Teori: Infeksi Rubella atau yang dikenal juga sebagai German Measles penyebabnya adalah virus Rubella. Gejala klinisnya berupa Mild Exanthem (ruam sedang) atau seringkali subklinikal. Meskipun demikian apabila ditemukan dalam uterus maka virus Rubella dapat menyebabkan Rubella Congenital dan dapat mengakibatkan keguguran, katarak, cacat tubuh, ketulian atau retardasi mental. Pemeriksaan serum antibodi IgG spesifik terhadap virus Rubella ditujukan untuk evaluasi adanya respon serologi (seroconversion) terhadap infeksi Rubella primer atau yang pernah terpapar. Dan aplikasi langsung dari pemeriksaan ini sangat berperan dalam skerining pra dan tri semester kehamilan. Apabila mereka tidak mempunyai kekebalan mereka tidak perlu khawatir terinfeksi selama kehamilan. Apabila mereka tidak mempunyai

kekebalan dan tidak sedang hamil maka dapat memperoleh vaksinasi Rubella. Pemeriksaan serum antibodi IgM spesifik terhadap virus Rubella ditujukan untuk evaluasi adanya Rubella aktif atau infeksi akut Rubella. Dan aplikasi langsung dari pemeriksaan ini sangat berperan dalam skerining pra dan tri semester kehamilan. Apabila mereka tidak mempunyai kekebalan mereka tidak perlu khawatir terinfeksi selama kehamilan. Apabila mereka tidak mempunyai kekebalan dan tidak sedang hamil maka dapat memperoleh vaksinasi Rubella. 

Alat dan Bahan : Alat

: -

Mini Vidas (Mini Vidas adalah alat yang digunakan untuk pemeriksaan Imunologi dengan metode ELFA (Enzymed Link Fluorescent Assay )

Bahan :

-

Blue dan Yellow TIP

-

Pipet Otomatis

-

Sentrifuge

-

Cup Sampel - Serum -Plasma EDTA

- Reagen Anti Rubella IgG (Mini Vidas) Cara Kerja : MINI VIDAS o

Persiapan alat :

1. Pastikan kabel listrik telah disambung ke aliran listrik yang benar 2. Nyalakan power switch ( ON/OFF ) yang terdapat dibagian belakang tengah bawah instrument

3. Instrument akan melakukan start up yang berlangsung beberapa menit 4. Instrument akan siap dipakai apabila “main menu” pada layar telah tampil

o

Kalibrasi dan control

1. Keluarkan kalibrasi dan control dari kulkas biarkan mencapai suhu kamar, jika kalibrasi dan control berbentuk Lyphilized, maka encerkan sesuai pakage insert, keluarkan juga strip SPR dan pipet. 2. Cara Running Kalibrasi dan control : 3. Dari main menu tekan status screen “tekan section”A” atau “B” pilih section yang available 4. Pada section yang dipilih tekan angka 1 ( satu ) 5. Pada section A1, tekan “Assay” pilih test/parameter yang akan diperiksa 6. Tekan “S” ( untuk standard/keluar secara otomatis atau dipilih untuk S1 atau S2 ) lalu tekan enter 7. Tekan “C” untuk mengetes control lalu masukkan nomor control ( 13), lalu tekan previous screen sampai section yang dipilih 8. Masukkan strip SPR dan pipet SPR ke dalam SPR block sesuai parameter yang dikehendaki tepat diatas reagen strip 9. Tutuplah dengan baik strip tray cover dan SPR Compartment Door, tekan tombol start, lalu masukkan nomor operator ID, pengetesan section tersebut dimulai

o

Running sample

1.

Dari menu pilih status screen, pilih section A atau B, pilh yang

available 2.

Pada section yang dipilih akan terlihat posisi 1-6

3.

Tekan angka 1 dan pada tampilan A1 atau B1

4.

Tekan Assay untuk pilih pemeriksaan

5.

Tekan sample ID, lalu masukkan nama pasien atau nomor Lab

sample, untuk huruf menjalankan cursor kotak huruf yang diinginkan dengan tanda panah, lalu tekan tombol yang segaris dengan kotak semua huruf disamping kanan, dan untuk angka tekan tombol angka secara langsung setelah selesai tekan enter 6.

Posisi section akan berubah ke A2 atau B2, lalu masukkan sample

ID berikutnya sama seperti diatas atau pilih assay hanya untuk pemeriksaan yang protokolnya sama dan dapat di Run dalam section yang sama 7.

Masukkan strip SPR dan pipet SPR ke dalam block SPR sesuai

pemeriksaan dan tepat diatas reagent strip 8.

Jika memasukkan sample ID sudah selesai, tekan previous screen

sampai penampilan section lalu tekan start, masukkan nomor ID operator maka pengerjaan sample sudah dimulai Catatan 1. Pada pengerjaan kalibrasi, control dan sample bias dilakukan bersamaan 2. Kalibrasi dan control hanya dilakukan 2 minggu sekali

4. PEMERIKSAAN DEMAM BERDARAH DENGUE (DBD) 

Metode: Immunokromatografi assay (Rapid Test)



Tujuan:

Untuk mendeteksi adanya antibody IgG dan IgM yang diproduksi oleh tubuh untuk virus dengue 

Prinsip: Setelah sampel ditambahkan ke alat tes bersama dengan pengencer atau buffer, campuran tersebut melewati antibodi yang mengikat yang kemudian mengikat imunoglobulin dalam sampel tersebut



Dasar Teori: Penyakit Demam Berdarah Dengue (DBD) disebabkan oleh virus dengue. Virus dengue mempunyai 4 serotipe, yaitu Den 1, 2, 3, dan 4. virus dengue dapat menyebabkan manifestasi klinis yang bermacam-macam dari asimtomatik sampai fatal. Demam dengue atau dengue fever (DF) merupakan manifestasi klinis yang ringan, sedang DBD atau dengue hemorrhagic fever / dengue shock syndrome (DHF/DSS) merupakan manifestasi klinik yang berat. Penelitian patogenesis sampai sekarang merupakan penelitian yang sangat menantang. Hal itu disebabkan teori patogenesis yang bermunculan belum mampu menerangkan secara tuntas fenomena klinik yang terjadi. Menurut sejarah perkembangan patogenesis DBD dalam kurun waktu hampir seratus tahun ini, dapat dibagi dua teori patogenesis, yaitu : pertama virus dengue mempunyai sifat tertentu, dan yang kedua pada manusia yang terinfeksi mengalami suatu proses imunologi yang berakibat kebocoran plasma, perdarahan, dan pelbagai manifestasi klinik. Dapat pula kemungkinan patogenesis campuran dari kedua mekanisme tersebut.



Alat dan Bahan: Alat

: - Strip Test - Pipet tetes -Tabung reaksi kecil + rak

Bahan

: - Sampel serum - Sampel dilution buffer



Cara Kerja : 1.

Disiapkan alat dan bahan yang akan digunakan.

2.

Dimasukkan 2-4 tetes serum pada kolom sampel.

3. Teteskan buffer sebanyak 2 tetes 4. Tunggu hingga 15 menit lalu baca hasil pemeriksaan.



Interpretasi Hasil :

(+) Bila menghasilkan garis pink/garis ungu di daerah T (test) strip dan di daerah C (kontrol) (-)Bila menghasilkan garis pink/garis ungu di daerah C (control)

RINGKASAN Virus RNA adalah virus yang materi genetiknya berupa asam nukleat yang berbentuk rantai tunggal atau ganda tidak berpilin. Di dalam sel inangnya, RNA pada virus akan mengalami transkripsi balik menjadi Hibrid RNA-DNA dan akhirnya membentuk DNA. Selanjutnya DNA virus akan masuk ke inti sel inangnya, menyisip ke dalam DNA inangnya. DNA virus akan merusak DNA inangnya dan membentuk mRNA. mRNA akan mengalami translasi untuk menghasilkan protein selubung virus untuk menbentuk virus – virus baru. Virus RNA diklasifikasikan menjadi Orthomyxoviruses, Paramyxoviruses, Rhabdoviruses, Picornaviruses, Togaviruses, Reoviruses dan Retroviruses. Penyakitpenyakit yang disebabkan virus RNA antara lain : Pilek, Influenza, Campak, Rubella, Demam berdarah, Hepatitis A, rabies, AIDS, SARS, gondongan, flu burung.

LATIHAN PEMAHAMAN 1.

Berikut ini yang bukan merupakan sifat-sifat dari virus adalah ….. a. Hanya memiliki satu macam asam nukleat (AND atau ARN) b. Virus bukan sel, jadi tidak memiliki protoplasma c. Bentuk dan ukuran virus bervariasi d. Untuk reproduksinya hanya membutuhkan bahan anorganik saja e. Virus dapat aktif pada makhluk hidup yang spesifik Jawaban: a. hanya memiliki satu asam nukleat (ADN atau ARN).

2.

Virus RNA diklasifikasikan berdasarkan… a. jenis asam nukleat b. tropisme dan penyebaran c. genom d. bentuk e. sel inang Jawaban : a. jenis asam nukelat

3.

Berikut adalah penyakit yang disebabkan oleh virus pada manusia, kecuali…. a. Polio b. Influenza c. HIV d. Herpes e. tungro Jawaban : e. Tungro

4.

Rabdoviridae adalah virus penyebab penyakit… a. Rubella b. Rabies c. Campak d. Gondongan e. AIDS

5.

Rubella termasuk penyakit yang disebabkan golongan virus RNA… a. Orbidivirus b. Coronaviridae c. Paramyxovirus d. Togaviridae e. Retroviridae

BAGIAN 3

SUB TOPIK/SUB JUDUL

: Virus DNA

TUJUAN INSTRUKSIONAL

: Mampu melakukan identifikasi Terhadap Virus DNA : Kemampuan melakukan identifikasi virus DNA dan laporan hasil praktikum

INDIKATOR

URAIAN MATERI

:

2. Berikut Uraian Beberapa Klasifikasi Virus 1. Berdasarkan Asam Nukleatnya Virus dibedakan menjadi: a) Virus DNA, contohnya: 

Poxvirus



Herpesviruses



Adenoviruses



Papovaviruses



Parvoviruses

b) Virus RNA, contohnya:  Orthomyxoviruses  Paramyxoviruses  Rhabdoviruses  Picornaviruses

 Togaviruses  Reoviruses  Retroviruses

2. Berdasarkan Bentuk Dasarnya, virus dibedakan menjadi: 1. Virus bentuk Ikosahedral Yaitu bentuk virus tata ruang yang dibatasi oleh 20 segitiga sama sisi, dengan sumbu rotasi ganda, contohnya virus polio dan adenovirus. 2. Virus bentuk Heliks Yaitu menyerupai batang panjang, nukleokapsid merupakan suatu struktur yang tidak kaku dalam selaput pembungkus lipoprotein yang berumbai dan berbentuk heliks, memiliki satu sumbu rotasi. Pada bagian atas terlihat RNA virus dengan kapsomer, misalnya virus influenza, TMV. 3.

Virus bentuk Kompleks Yaitu struktur yang amat kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. Contoh virus pox (virus cacar) yang mempunyai selubung yang menyelubungi asam nukelat.

3. Berdasarkan jumlah kapsomernya, virus dibedakan menjadi: 1) Virus dengan 252 kapsomer, contoh adenovirus 2) Virus dengan 162 kapsomer, contoh herpesvirus 3) Virus dengan 72 kapsomer, contoh papovavirus 4) Virus dengan 60 kapsomer, contoh picornavirus 5) Virus dengan 32 kapsomer, contoh parvovirus

4. Berdasarkan sel Inangnya, virus dibedakan menjadi: 1) Virus yang menyerang manusia, contoh HIV

2) Virus yang menyerang hewan, contoh rabies 3) Virus yang menyerang tumbuhan, contoh TMV 4) Virus yang menyerang bakteri, contoh virus T

5. Berdasarkan Tempat Hidupnya a. Virus bakteri (bakteriofage) Bakteriofage adalah virus yang menggandakan dirinya sendiri dengan menyerbu bakteri. Dibandingkan dengan kebanyakan virus, ia sangat kompleks dan mempunyai beberapa bagian berbeda yang diatur secara cermat. Semua virus memiliki asam nukleat, pembawa gen yang diperlukan untuk menghimpun salinan-salinan virus di dalam sel hidup. Virus bakteriofage mula-mula ditemukan oleh ilmuwan Prancis, D'Herelle. Bentuk luar terdiri atas kepala yang berbentuk heksagonal, leher, dan ekor. Bagian dalam kepala mengandung dua pilinan DNA. Bagian leher berfungsi menghubungkan bagian kepala dan ekor. Bagian ekor berfungsi untuk memasukkan DNA virus ke dalam sel inangnya.

b. Virus tumbuhan Virus yang parasit pada sel tumbuhan. Contoh virus yang parasit pada tumbuhan: Tobacco Mozaic Virus (TMV) dan Beet Yellow Virus (BYV).

Gambar. Tobbaco Mozaic Virus pada daun Tembakau

c. Virus hewan Virus yang parasit pada sel hewan. Contoh virus hewan: virus Poliomylitis, virus Vaccina, dan virus Influenza

VIRUS DNA

A. Asam Nukleat DNA

1. Asam Nukleat DNA berbentuk Icosahedral, Tidak Beramplop a) Parvovirus Famili

: Parvoviridae

Parvoviridae merupakan virus DNA rantai

tunggal,

berukuran

kecil, dan tidak berkapsul. Parvovirus adalah virus yang umumnya menyerang manusia, separuh dari orang dewasa pasti pernah terkena pada masa kanak-kanaknya atau masa remajanya.

Morfologi Parvoviridae

Virion

: ikosahedral, berdiameter 18-26 nm, 32 kapsomer

Komposisi

: DNA (20 %), protein (80%)

Genom

: DNA untai tunggal, linier, 5,6 kb, BM 1,5-2,2 juta

Protein

: Dua selubung protein

Selubung

: tidak punya selubung

Replikasi

: Inti, berrgabung pada fungsi sel inang yang

membelah diri Karateristik utama : Virus sangat sederhana, satu genus adalah cacat,replikasi dan memerlukan inang. Sel inang

: Pinaedae ( Keluarga Udang )

Klasifikasi Parvoviridae

Famili parvoviridae terbagi menjadi tiga genus, yaitu : a.

Parvovirus Berikut beberapa spesies yang tergolong genus Parvovirus : 

Canine parvovirus



Chicken parvovirus



Faline panleukopenia virus



Feline parvovirus



Kilham rat virus



Lapine parvovirus Mink enteritis virus.

b. Erytrovirus, contoh spesies : Primate erythroparvovirus 1 ( Parvovirus B19) c. Devendoparvovirus, contoh spesies : Adeno associated virus ( AAV ).

1. Canine parvovirus ( CPV ) Kelompok

: DNA virus

Family

: Parvoviridae

Genus

: Parvovirus

Spesies : Canine parvovirus Canine parvovirus adalah virus dari genus parvovirus yang menyerang anjing.

CPV berkerabat dekat dengan panleukopenia

virus dan mink enteritis virus. CPV bereplikasi pada sel-sel usus, sistem limfoid, sumsum tulang dan jaringan fetus. Efek yang ditimbulkan oleh CPV pada jaringan tersebut umumnya parah. Pada kondisi pH dan suhu yang sesuai, CPV menghemaglutinasi sel darah merah pada beberapa spesies hewan. Efek mengaglutinasi sel darah merah dapat hilang pada fase yang berulang kali di kultur jaringan. Namun, test hemaglutinasi dapat digunakan untuk menguji keberadaan CPV dengan menggunakan spesimen berupa feses. Gejala klinis infeksi CPV pada anak anjing yaitu diare cair atau diare berdarah, muntah secara berulang, dan anoreksia. Gejala klinis lainnya yaitu demam, kelemahan tubuh,limfopenia terutama neutropenia. Hewan juga mengalami dehidrasi, penurunan berat badan, dan rasa sakit di bagian abdominal.

2

Primate erythroparvovirus ( Parvovirus B19 ) Kelompok : DNA virus Family

: Parvoviridae

Genus

: Erythroparvovirus

Spesies

: Primate erythroparvovirus

Primate

erythroparvovirus

adalah

virus

dari

genus

erythroparvovirus yang menyerang manusia. Parvovirus B19 ini, dapat menyebabkan terjadinya penyakit krisis aplastis sementara (Parvovirus B19 merupakan penyebab dari krisis aplastis sementara yang dapat mempersulit anemia hemolitik kronis ) dan Infeksi pada Pasien Imunodefisiensi (Parvovirus B19 dapat menyebabkan anemia kronik pada pasien dengan imun yang terganggu ). Parvovirus B19 dapat ditemukan dalam darah dan dalam sekresi pernafasan pasien yang teinfeksi, penularan parvovirus dapat terjadi melalui ;  Virus dapat tersedar melalui lender pernafasan orang yang terkena misalnya lewat batuk.  Secara parenteral melalui tranfusi darah atau melalui produk darah yang terinfeksi.  Secara vertical dari ibu ke janinnya Gejala klinis yang ditimbulkan dari seseorang yang terinfeksi virus Parvovirus B19 pada anak-anak diantaranya :

demam, gangguan

pernafasan, ruam seperti bekas tamparan muncul di kedua pipi, namun setelah lewat dua hari sampai empat hari, barisan ruam menyebar ke seluruh tubuh, lengan dan kaki. Sedangkan pada orang dewasa gejala yang ditimbulkan hanya berupa sakit sendi atau bengkak. 3. Adeno Associated Virus ( AAV ) Kelompok Family Genus Spesies

: DNA virus

: Parvoviridae : Devendoparvovirus : Adeno associated virus

Reproduksi Parvoviridae

Replikasi parvovirus beruntai tunggal dimulai ve dan ve-stranded DNA + ketika dari partikel parvovirus berbeda datang bersama untuk membentuk sebuah molekul DNA beruntai ganda dari yang transkripsi dan replikasi berlangsung.

Penyakit yang disebabkan Parvoviridae

Ada dua tipe parvoviridae yaitu virus tipe jantung dan tipe alat pencernaan. Serangan parvovirus tipe alat pencernaan akan menunjukkan gejala antara lain penderita menjadi sangat depresif, nyeri perut serta sering muntah dan mencret dan baunya sangat menusuk. Gejala akibat serangan parvovirus tipe jantung antara lain radang otot jantung yang sangat fatal disertai timbunan cairan didalam paru-paru. Virus tipe ini akan mengakibatkan kematian yang sangat cepat dan mendadak.

b) Papovarius Famili : Papovaviridae Istilah "Papovavirus" berasal dari dua huruf pertama dari nama tiga anggota kelompok ini: pa pillomavirus, mouse po lyoma virus, dan va simian cuolating virus (SV40). Anggota dari kelompok ini dapat menginduksi tumor pada rentan host dan mengubah karakteristik morfologi sel dalam budaya. Papovavirus merupakan virus kecil ( diameter 45-55 nm ) yang mempunyai genom beruntai ganda yang sirkuler diliputi oleh kapsid (kapsid ini berperan pada tempat infeksi pada sel) yang tidak berpembungkus menunjukkan bentuk simetri ikosahedral. Berkembang biak pada inti sel menyebabkan infeksi laten dan kronis pada pejamu alamiahnya dan dapat menyebabkan tumor pada beberapa binatang (Contoh : Virus Papilloma manusia (kutil), Virus BK (diasingkan dari

air kemih penderita yang mendapat obat-obat imunosupresif)). Sub familinya poliomavirus JC dan BK. Virus JC dapat menyebabkan suatu infeksi neurologis berat pada penderita dengan gangguan kekebalan tubuh.

Struktur Papovaviruses kecil, yang tidak memiliki amplop, virus ikosahedral yang mengandung melingkar, DNA beruntai ganda. Partikel virus berkisar diameter 45-55 nm. Papovaviruses berisi jumlah terbatas informasi genetik (enam atau tujuh gen); DNA memiliki berat molekul 3 × 106-5 × 106. Dua atau tiga polipeptida digunakan untuk membangun kapsid ikosahedral yang paket DNA genom. Histon selular dimasukkan ke dalam virion dalam hubungan erat dengan DNA virus, mungkin untuk membantu dalam kondensasi DNA di dalam kapsid.

Klasifikasi dan antigenik Jenis

Papovaviruses dibagi menjadi dua genera, polyomavirus dan Papillomavirus, berdasarkan sifat fisikokimia dan biologi. 1. polyomaviruses Polyomaviruses, yang lebih kecil dari papillomaviruses, sekitar 45 nm diameter dan memiliki genom sekitar 3 × 106 dalton (kurang lebih 5.200 bp). Virus ini cenderung untuk mendorong terus-menerus, infeksi tampaknya tidak berbahaya di alam semesta alam mereka. Mereka telah menarik perhatian para ilmuwan penelitian karena mereka menginduksi tumor saat disuntikkan ke tikus. Selain itu, karena kandungan genetik kecil, polyomaviruses telah melayani model sistem yang sederhana untuk menjelajahi peristiwa molekuler dalam transformasi dan proses biologis sel mamalia lainnya. Salah satu produk gen awal SV40, antigen tumor besar (T antigen), diperlukan untuk replikasi DNA virus selama infeksi produktif dan untuk inisiasi dan pemeliharaan fenotip berubah. Dua polyomaviruses, virus BK dan virus JC, yang ditemukan pada manusia. Manusia dan hewan polyomaviruses semua antigen yang berbeda. Hanya satu serotipe dikenal untuk setiap agen. Genom virus simian 40 (SV40), sebuah polyomavirus yang telah dipelajari secara intensif, yang diagrammed pada Gambar 66-1. Struktur genetik dari virus manusia dalam genus ini, JC dan BK virus, erat menyerupai SV40. The polyoma virus tikus berbeda hanya dalam bahwa kode untuk sebuah produk gen awal tambahan. Seluruh urutan nukleotida DNA beberapa Papovavirus telah ditentukan. Sekitar setengah dari genom SV40 mengkodekan protein nonstruktural yang disajikan sebelum sintesis DNA virus dimulai. Produk daerah yang ditujukan fungsi awal. Protein awal juga disebut sebagai antigen tumor karena mereka pertama kali terdeteksi pada tumor yang diinduksi virus dengan menggunakan serum dari hewan tumor-bearing. Sisi lain dari

kode genom virus untuk protein struktural virion, yang disebut fungsi terlambat karena mereka disajikan setelah sintesis DNA virus dimulai. Protein struktural membentuk mantel protein partikel virus. Virus ini memaksimalkan penggunaan jumlah mereka yang terbatas dari informasi genetik. Beberapa protein virus-dikodekan dikodekan sebagian oleh daerah bersama tentang DNA (misalnya, VP2 dan VP3; t kecil dan antigen T besar). Protein lain dijabarkan dari frame membaca yang berbeda dari tumpang tindih wilayah DNA (misalnya, VP2 dan VP1) Kedua polyomaviruses manusia yang dikenal telah dipelajari secara ekstensif. Virus BK diisolasi dari urin dari penerima allograft ginjal yang menjalani terapi imunosupresif, sedangkan virus JC telah pulih dari jaringan otak dari pasien dengan PML, penyakit demielinasi langka. Kedua virus antigen berbeda satu sama lain dan dari anggota lain dari genus polyomavirus, tetapi protein awal (antigen tumor) disebabkan oleh BK dan JC virus memiliki beberapa determinan antigenik sama dengan SV40.

Manifestasi klinis

Polyomaviruses membangun gigih, infeksi berbahaya di penjamu alami mereka. Virus BK belum terbukti menyebabkan penyakit klinis. Virus JC dianggap menyebabkan PML, penyakit langka karena infeksi virus JC oportunistik individu dengan gangguan imunitas. Sejumlah besar partikel virus yang hadir dalam inti sel glial dalam lesi otak pasien dengan PML. Onset penyakit ini berbahaya. Gejala awalnya berupa kelainan berbicara dan visi dan perubahan dalam fungsi mental. Penyakit ini bersifat progresif, yang berpuncak pada koma dan kematian, biasanya dalam waktu 6 bulan dari onset.

Patogenesis

Kedua polyomaviruses manusia di mana-mana di antara manusia, dengan infeksi awal yang terjadi selama masa kanak-kanak. Infeksi primer harus mencakup fase viremic, karena kedua BK dan JC virus bertahan dalam ginjal orang sehat setelah infeksi primer dan dapat mengaktifkan ketika respon kekebalan tubuh inang terganggu. Hal ini tidak diketahui apakah virus JC mencapai otak selama infeksi primer dan tetap ada dalam bentuk laten sampai diaktifkan oleh imunosupresi, atau apakah itu menyerang otak setelah reaktivasi infeksi persisten di lokasi jauh, seperti ginjal. PML kadang-kadang berkembang pada pasien

AIDS.

Fitur

khas

dari

penyakit

ini

adalah

adanya

oligodendrocytes diubah mengandung partikel banyak Papovavirus di inti mereka dan kehadiran astrosit raksasa dengan inti hiperkromatik. Demielinisasi terjadi karena virus JC menyebabkan infeksi litik dari oligodendrocytes. Dalam lesi canggih, oligodendrocytes yang absen karena nekrosis sel. 2. papillomaviruses The papillomaviruses yang sedikit lebih besar dari polyomaviruses, dengan genom DNA sirkular yang lebih kompleks . Berbeda dengan polyomaviruses, para papillomaviruse menginduksi tumor pada penjamu alami mereka. Papillomaviruses telah ditemukan di banyak spesies, termasuk manusia, kelinci, sapi, dan anjing. Mereka sangat spesies tertentu dan tidak diketahui untuk menyeberangi hambatan spesies inang. Mereka terkait dengan berbagai lesi papillomatous jinak kulit dan mukosa skuamosa. Organisasi genom papillomaviruses berbeda secara signifikan dari polyomaviruses. Studi telah terhambat oleh kurangnya sistem kultur jaringan yang mampu mendukung replikasi papillomavirus in vitro. Namun,

teknologi

DNA

rekombinan

telah

digunakan

untuk

mengkloning beberapa genom papillomavirus. Urutan nukleotida analisis telah mengungkapkan setidaknya enam frame baca terbuka.

Dua adalah "terlambat" frame baca terbuka yang mengkode protein kapsid; lain "awal" frame baca terbuka yang terlibat dalam replikasi virus dan transformasi seluler. Peta

manusia

papillomavirus

tipe

16

genom

(genus

Papillomavirus). DNA melingkar, tetapi ditampilkan linierisasi di wilayah noncoding (NCR). Genom ditandai berpasangan kilobase. Papillomaviruses tidak dapat dikultur in vitro, dan tidak ada reagen serologi yang tersedia untuk membedakan isolat manusia. Jenis human papillomavirus dibedakan berdasarkan homologi DNA. Setiap jenis saham kurang dari 50 persen homologi dengan semua jenis lain yang diakui dalam kondisi hibridisasi DNA ketat. Sebuah definisi baru dari genotipe, berdasarkan data sekuens DNA, adalah bahwa dua jenis berbeda 10 persen atau lebih dalam nukleotida dalam urutan L1, E6, dan E7. Lebih dari 70 jenis yang berbeda telah diidentifikasi, masingmasing cenderung berhubungan dengan kondisi patologis tertentu. Papillomavirus isolat dari spesies binatang yang berbeda yang secara serologis berbeda. Antiserum disiapkan terhadap partikel virus utuh adalah jenis tertentu dan tidak akan bereaksi dengan jaringan terinfeksi oleh jenis lain dari papillomavirus, tapi antisera terhadap virion terganggu oleh deterjen bereaksi silang dengan antigen kapsid semua papillomaviruses, termasuk dari spesies lain. Hal ini mencerminkan

adanya

urutan

konservasi

protein

struktural

papillomavirus yang tidak terkena pada permukaan partikel virus.

Manifestasi klinis

Berbagai lesi papillomatous jinak kulit dan mukosa skuamosa yang disebabkan oleh human papillomavirus. Ini termasuk umum dan plantar kutil, kutil datar, anal dan genital kondiloma acuminata, kutil

datar serviks, lesi makula pityriasis seperti pada pasien dengan verruciformis epidermodysplasia, papiloma oral, dan papiloma laring remaja. The papiloma laring dapat berbahaya karena mereka terjadi pada anak-anak, cenderung menyebabkan obstruksi saluran pernapasan akut, dan sering kambuh. Infeksi papillomavirus mungkin subklinis. Perubahan klinis yang paling umum pada laki-laki dan perempuan adalah acuminata kondiloma (kutil anogenital). Infeksi Papillomavirus terjadi sepanjang lebih rendah saluran kelamin perempuan. Beberapa situs yang sering terlibat, termasuk pada serviks, di vagina, dan di wilayah vulva. Selain itu, lesi disebut neoplasia intraepitel serviks berhubungan dengan infeksi HPV. Lesi ini diyakini mencerminkan dysplasia serviks ringan sampai sedang dan ditandai oleh sel-sel bulat besar yang disebut koilocytes. Pada pria, condylomas anal dan kutil penis terjadi secara terpisah atau bersama-sama. Epidermodysplasia verruciformis adalah penyakit kulit langka yang ditandai dengan lesi disebarluaskan menyerupai kutil datar dan makula kemerahan. Kebanyakan lesi papillomavirus diinduksi sepenuhnya jinak dan tidak berkorelasi dengan transformasi maligna. Namun, lesi anogenital papillomavirus terkait manusia tertentu dapat berkembang

menjadi

epidermodysplasia

karsinoma

verruciformis

sel pasien

skuamosa. dapat

Selain

itu,

mengembangkan

karsinoma kulit, dan kasus yang jarang terjadi dari laring papillomatosis menjadi ganas.

Patogenesis

Papillomaviruses menyebabkan papiloma jinak pada kulit dan mukosa skuamosa. Virus ditularkan melalui kontak dan memasuki tubuh melalui lecet menit di kulit. Kontrol pertumbuhan sel terganggu, mengakibatkan penebalan epidermis dengan hiperplasia di spinosum

stratum dan beberapa derajat hiperkeratosis. Badan inklusi intranuklear basophilic sering terjadi pada stratum granulosum. Membran basal tetap utuh. Jenis human papillomavirus yang berbeda-beda menyebabkan lesi patologis yang berbeda, meskipun pengecualian memang terjadi. Sebuah tipe tertentu sedikit yang sangat terkait dengan perkembangan penyakit kelamin premalignant dan malignant. Lebih dari 90 persen kanker serviks di seluruh dunia positif untuk papillomavirus DNA, sekitar setengah dari yang jenis 16. Banyak neoplasias intraepitel serviks prakanker, serta penis dan vulva kanker, juga membawa DNA HPV. DNA virus juga telah terdeteksi pada kanker laring, orofaring, dan lidah. Atas dasar terjadinya relatif DNA virus di jaringan kanker tertentu, jenis human papillomavirus yang ditemukan bervariasi dalam potensi onkogenik. Tipe 16 dan 18 dianggap menimbulkan risiko kanker tinggi; ketik 31, risiko menengah; dan tipe 6 dan 11, risiko rendah. Banyak jenis lainnya dianggap jinak. Untuk alasan ini, itu akan menjadi penting untuk mengidentifikasi jenis spesifik hadir dalam lesi klinis.

c) Adenovirus

Gambar Adenovirus berbentuk ikosahedral

Adenoviridae adalah keluarga virus yang memiliki inang vertebrata. Bentuk virus ini ikosahedral dengan diameter virion 70100nm dan genom 36-38kb. Adenoviridae memiliki dua genus yaitu Mastadenovirus dan Aviadenovirus Manifestasi Klinik Contoh spesiesnya adalah virus adenovirusJenis virus ini pertama kali ditemukan oleh Rowe pada tahun 1953.Adenovirus adalah sekelompok virus yang bertanggung jawab untuk berbagai penyakit pernapasan serta infeksi lambung dan usus (gastroenteritis), mata (konjungtivitis), dan kandung kemih (sistitis) dan ruam. Penyakit pernapasan oleh adenovirus termasuk pilek, pneumonia, croup, dan bronkitis. Pasien dengan sistem kekebalan tubuh sangat rentan terhadap komplikasi berat dari infeksi adenovirus. Adenoviridae kebanyakan menyerang anak-anak dan orang militer dengan menginfeksi saluran pernapasan, infeksi pada mata, radang kantung kemih yang menyebabkan hematuria, serta encephalitis.

Fitur Epidemiologi

Meskipun epidemiologi karakteristik adenovirus bervariasi menurut jenis, semua ditularkan melalui kontak langsung, transmisi fecal-oral,

dan

kadang-kadang

transmisi

ditularkan

melalui

air. Beberapa jenis dapat membangun infeksi asimtomatik persisten di amandel, kelenjar gondok, dan usus dari host yang terinfeksi, dan mencurahkan

dapat

terjadi

selama

berbulan-bulan

atau

tahun. Beberapa adenovirus (misalnya, serotipe 1, 2, 5, dan 6) telah terbukti endemik di bagian dunia di mana mereka telah dipelajari, dan infeksi biasanya diperoleh selama masa kanak-kanak. Jenis lain menyebabkan infeksi sporadis dan wabah sesekali, misalnya,

keratoconjunctivitis epidemi dikaitkan dengan serotipe, adenovirus 8 19,

dan

37. Wabah

penyakit

demam

dengan

konjungtivitis

berhubungan dengan transmisi ditularkan melalui air dari beberapa jenis adenovirus, sering berpusat di sekitar kolam renang tidak cukup diklorinasi dan danau kecil. ARD yang paling sering dikaitkan dengan jenis adenovirus 4 dan 7, dan lebih baru-baru ini adenovirus 14, di Amerika Serikat. Adenovirus enterik 40 dan 41 menyebabkan gastroenteritis, biasanya pada anak-anak.Untuk beberapa serotipe adenovirus, spektrum klinis penyakit yang berhubungan dengan infeksi bervariasi tergantung pada tempat infeksi, misalnya, infeksi dengan 7 adenovirus diakuisisi oleh inhalasi berkaitan dengan penyakit saluran napas bawah berat, sedangkan lisan virus biasanya menyebabkan tidak ataupenyakit ringan. Masa inkubasi yang khas untuk Gastroenteritis adalah 3-10 hari, untuk infeksi saluran pernafasan itu adalah antara 2 dan 14 hari Wabah penyakit pernafasan adenovirus-terkait telah lebih sering terjadi di akhir musim dingin, musim semi, dan awal musim panas, namun, infeksi adenovirus dapat terjadi sepanjang tahun.

Penularan Adenovirus ditularkan melalui kontak langsung, transmisi fekal-oral, dan melalui air. Beberapa jenis adenovirus mampu membangun infeksi asimtomatik persisten di amandel, kelenjar gondok, dan usus. Pengenyahan virus dapat terjadi selama berbulan-bulan atau tahun setelah infeksi awal. Diagnosa Antigen deteksi, polymerase chain uji reaksi, isolasi virus dan serologi dapat

digunakan

adenovirus. Adenovirus

untuk mengetik

mengidentifikasi biasanya

dilakukan

infeksi dengan

hemaglutinasi-penghambatan dan / atau netralisasi dengan antiserum tipe-spesifik

atau

menggunakan

metode

hexon

urutan

gen

molekuler. Sejak adenovirus dapat dikeluarkan dalam waktu yang panjang, keberadaan virus tidak selalu berarti hal yang berhubungan dengan penyakit. Perawatan dan pengobatan Kebanyakan infeksi jenis virus ini adalah ringan dan tidak memerlukan pengobatan kecuali pengobatan pada gejalanya. Karena tidak ada terapi khusus virus, penyakit adenovirus serius dapat dikontrol hanya melalui pengobatan gejala dan komplikasi infeksi-nya. Kematian sangat langka terjadi. Pencegahan Penyakit ini dapat menular melalui jalur fecal-oral (dari kotoran ke mulut), sehingga menjaga kebersihan tangan sebelum makan sangat dianjurkan. Juga dalam hal ini, hindari hubungan teknik seks tertentu yang beresiko menjadi jalur fecal-oral ini misal: anilingus, coprophilia, and ass to mouth. Menjaga tingkat chlor yang memadai sangat diperlukan untuk mencegah kolam renang menjadi sumber penyakit ini. B. Asam Nukleat DNA berbentuk Icosahedral, Beramplop a. Herpesvirus Penyakit herpes disebabkan oleh virus yaitu Herpes simplek tipe 1. (HSV-1) atau Herpes simplek tipe 2 (HSV-2). Kedua Herpes ini mempunyaiinti DNA ganda yang dikelilingi oleh lapisan

protein

yang

menunjukkansimetri

ikosahedral

dan

mempunyai 162 kapsomer.Nukloeokapsida dikelilingi oleh suatu selubung yang dihasilkan oleh membran inti dari sel yangterinfeksi dan mengandung glikoprotein virus berbentuk paku dengan

panjang kurang lebih 8 nm. Struktur yang tidak terbentuk kadangkadang

asimetridiantara

kapsid

dan

selubung

membentuk

tegument.Bentuk selubungberukuran 120 nm sampai dengan 200 nm.

Virion

:

Bulat,berdiameter120-200nm

Genom

:

DNA untai ganda, linear

Protein

:

Lebih dari 35 protein dalam prion

Ciri-ciri yang menonjol : HSV-1 menyebar melalui kontak, biasanya melibatkan air liur yang terinfeksi, sedangkan HSV-2 ditularkan secara seksual atau dari infeksi kelamin ibu ke anaknya yang baru lahir

Gambar. Struktur Virus Herves Simpleks (HSV)

Akibat yang ditimbulkan dari penyakit herpes ini adalah berupa luka pada kulit yang terkena virus, disertai dengan rasa nyeri serta panas,kemudian diikuti dengan lepuhan seperti luka bakar. Lepuhanlepuhan kulit yang menjadi ciri khas herpes akan mengelupas dengan atau tanpa pengobatan. Terkadang penderita tetap merasa nyeri dan panas meskipun lepuhan-lepuhan itu sudah kering dan mengelupas. Hal itu disebabkan karena virus herpes menyerang bagian saraf.Secara

periodik, virus ini akan kembali aktif dan mulai berkembangbiak, seringkali menyebabkan erupsi kulit berupa lepuhan pada lokasi yang sama dengan infeksisebelumnya. Virus juga bisa ditemukan di dalam kulit tanpa menyebabkan lepuhan yang nyata, dalam keadaan ini virusmerupakan sumber infeksi bagi orang lain. Timbulnya erupsi bisa dipicu oleh pemaparan cahaya, demam, stres fisik atau emosional, penekanan system kekebalan, dan obat-obatan atau makanan tertentu. Pada beberapa kasus, herpes genital biasanya tidak tidak menunjukka gejala sehingga penderita tidak mengetahui bahwa ia menghidap herpes. Gejala awal dari herpes genital, antara lain: • Rasa gatal dan terbakar di daerah genital atau anal • Rasa sakit sekitar kaki, pantat atau daerah genital • Keluarnya cairan dari vagina • Adanya perasaan seperti tertekan di daerah perut

Herpes kambuh ditandai dengan adanya kesemutan, rasa tidak nyaman, yang dirasakan beberapa jam sampai 2-3 hari sebelum timbulnya lepuhan. Lepuhan yang dikelilingi oleh daerah kemerahan dapat muncul dimana saja pada kulit atau selaput lender, tetapi lebih sering ditemukan di dalam dan disekitar mulut, bibir, dan alat kelamin. Lepuhan (yang biasanya terasa nyeri) cenderung membentuk kelompok yang bergabung satu sama lain membentuk sebuah kumpulan yang lebih besar.

Mekanisme Terjadinya Herpes

Herpes dapat terjadi melalui kontak kulit dengan penderita. Jika seseorang mempunyai herpes di mulutnya kemudian ia mencium orang lain, maka

orang itu dapat terkena herpes pula. Jika ia melakukan oral seks, maka herpes tersebut dapat menular ke kelamin walaupun kemungkinan menularnya lebih kecil dibandingkan jika terjadi kontak antar kelamin (hubungan seksual). Virus herpes mempunyai sifat yang berbeda-beda, ada yang menyukai daerah mulut dan ada pula yang menyukai bagian kelamin.

Gambar. Organ Tubuh yang Terkena Penyakit Herpes

Cara-cara infeksi yang dilakukan HSV ada 2 yaitu infeksi primer dan infeksi laten.

a) Infeksi primer

HSV ditularkan melalui kontak dari orang yang peka lewat virus yang dikeluarkan oleh seseorang. Untuk menimbulikan infeksi, virus harus menembus permukaan mukosa atau kulit yang terluka (kulit yang tidak terluka bersifat resisten). Infeksi HSV-1 biasanya terbatas pada orofaring, virus menyebar melalui saluranpernapasan atau melalui kontak langsung dengan air liur yang terinfekisi. HSV-2 biasanya ditularkan secara seksual. Perkembangbiakan virus terjadi pertama kali di tempat infeksi. Virus kemudian memasuki ujung saraf setempat dan dibawa melalui aliran akson ke ganglion dorsalis, tempat terjadinya perkembangbiakan selanjutnya, dan bersifat laten. Infeksi HSV primer biasanya

ringan, pada

kenyataannya,

sebagian besar bersifat

asimtomatik. Jarang terjadi penyakit sistemik. Penyebaran ke organorgan lain dapat terjadi jika system imun inang terganggu, dan hal ini tidak dapat menahan perkembangbiakan inang.

b) Infeksilaten

Virus terdapat pada ganglia yang terinfeksi secara laten dalam stadium non replikasi, hanya sedikit gen virus terekspresikan. Virus menetap pada ganglia yang terinfeksi secara laten sampai akhir hidup inang. Tidak dapat ditemukan virus ditempat kekambuhan atau didekat tempat biasanya lesi kambuh. Perangsangan yang provokatif dapat mengaktifkan kembali virus dari stadium laten, virus kemudian mengikuti jalannya akson kembali ke perifer, dan melakukan perkembangbiakan di kulit atau selaput mukosa. Terjadi pengaktifan kembali secara spontan walaupun terdapat imunitas seluler dan humoral yang spesifik pada inang. Namun, imunitas ini dapat membatasi perkembangbiakan virus setempat sehingga kekambuhan lesi tidak begitu luas dan tidak begitu berat. Banyaknya kekambuhan bersifat asimtomatik, diperlihatkan hanya oleh pelepasan virus dalam sekresi. Bila bersifat simtomatik, episode kekambuhan infeksi HSV-1 biasanya termanifestasi sebagai cold sores (demam lepuh) di dekat bibir. Dasar molekuler pengaktifan kembali ini tidak diketahui, secara efektifmenimbulkan perangsangan antaralain luka pada akson, demam, tekanan fisik atau emosi, dan pemaparan terhadap sinar ultraungu.

Gambar. Mekanisme Infeksi Virus Herpes pada Kulit

a. Asam Nukleat DNA Berbentuk Kompleks a. Poxvirus Famili poxviridae merupakan virus-virus yang strukturnya sangat kompleks dan mempunyai anggota yang jumlahnya banyak. Berdasarkan sifat antigenic dan kemampuan masing-masing virus untuk mengadakan rekombinasi,

makan

poxviridae

dibagi

menjadi

7

genera

yaitu

orthopoxvirus, leporipoxvirus, avipoxvirus, capripoxvirus, suipoxvirus, parapoxvirus dan ungrouped poxvirus. Terdapat netralisasi silang yang nyata antara virus-virus dalam satu genus tetapi tidak terjadi antara dua genus

yang

berbeda.

Tetapi

semua

poxvirus

memiliki

antigen

nukleoprotein (NP) bersama yang dapat diekstraksi dari dalam core.

Asam nukleat poxvirus adalah double-stranted linear DNA dengan berat molekul 150 x 106 dalton. Virion mempunyai selubung dengan kapsid simetris yang kompleks. Ukuran sekitar 250 x 400 nm dan replikasi terjadi di dalam sitoplasma dengan pembentukan inclusion body. Smallpox atau variola atau cacar merupakan penyakit menular akut yang disebabkan oleh virus poks (pox virus variolae). Cacar disebut Variola atau Variola Vera, berasal dari kata Latin ‘Varius‘ yang berarti bercak, atau gelembung kulit. Variola adalah penyakit virus yang disertai keadaan umum yang buruk menyebabkan manifestasi klinis berat dan dapat mengakibatkan kematian]. Penyebaran penyakit ini bersifat kosmopolit, tetapi pada daerah tertentu memberi insidens yang tinggi, misalnya di Amerika Tengah dan Selatan, Hindia Barat dan Timur Jauh[2]. Dikenal 2 tipe virus yang hampir identik tetapi menyebabkan 2 tipe variola, yaitu variola mayor dan variola minor (alastrim). Gejala terjangkitnya smallpox mirip gejala flu, termasuk demam tinggi, keletihan, sakit kepala, sakit punggung, dan diikuti munculnya ruam di kulit. Variola hampir mirip cacar air atau varisela atau chicken pox, tetapi vesikelnya jauh lebih banyak dan berisi tidak hanya cairan tapi juga nanah dan darah. Tidak ada pengobatan spesifik untuk penyakit ini, dan hanya imunisasi di seluruh dunia yang mampu menghentikan penyebaran

smallpox (yang dilakukan pada tiga dekade lalu). Kasus terakhir ditemukan di Somalia tahun 1977 dan sejak tahun 1984 oleh WHO seluruh dunia telah dinyatakan bebas dari penyakit ini. Hingga saat ini virus penyebab cacar masih disimpan di 2 negara, yaitu Amerika Serikat dan Rusia, hal ini masih menjadi perdebatan apakah virus itu tetap akan disimpan atau dimusnahkan. Virus pertama kali ditemukan oleh Adolf Meyer di Nederland pada tahun 1883. Penelitian tentang virus dilanjutkan oleh ahli botani berkebangsaan Rusia yaitu Dimitri Ivanowski (1892), dan Baijerinck (1899) berkebangsaan Jerman Keduanya meneliti pada Daun tembakau yang terdapat bercak putih (Mozaik). Kemudian Keduanya menyimpulkan bahwa penyakit mozaik pada tembakau disebabkan oleh virus. Pada penelitian yang lain Twort (1916) dan d’Herelle (1917) menemukan virus yang menyebabkan lisis pada bakteri yang disebut dengan bakteriofage. Virus adalah mikroorganisme yang sangat kecil dan mengandung molekul asam nukleat (DNA, atau RNA). Molekul asam nukeat ini yang membawa semua informasi genetik yang diperlukan untuk mengadakan replikasi di dalam sel yang dimasukinya. Sifat virus adalah merupakan parasit obligat pada sel yang hidup. Virus berbeda dengan makhluk lain karena mempunyai sifat-sifat seperti Virus hanya mengandung salah satu asam nukleat saja, DNA atau RNA, Untuk reproduksinya hanya diperlukan asam nukleat saja, dan Virus tidak memiliki kemampuan untuk memperbanyak diri di luar sel-sel hidup. Perkembangan virus dapat mengakibatkan kematian sel-sel hospes. Di luar sel hospes, virus terdapat sebagai partikel virus, yaitu virion. Virion terdiri dari asam nukleat dan selubung protein (kapsid/kulit protein yang simetris yang menutupi genom asam nukleat). Kapsid dan asam nukleat itu dinamakan nukleokapsid.

Virus merupakan mikroorganisme yang sangat hiperaktif jika berada di alam sel inangnya. Virus terdiri dari dua jenis, yaitu virus yang hanya memiliki asam nukleat berupa DNA dan RNA. Dalam hal ini hanya membahas mengenai virus DNA. Virus DNA dapat dikelompokkan menjadi empat kelompok. Kelompok pertama Papovirus, Adenovirus, dan Herpesvirus. Genom virus kelompok ini ditranskripsi dan direplikasi di dalam nukleus sel. Oleh karena itu, dapat menggunakan enzim inang. Kelompok kedua adalah Poxvirus. Proses transkripsi Poxvirus terjadi di sitoplasma. Proses transkripsi memerlukan enzim virus. Kelompok ketiga adalah Parvovirus. Virus terasosiasi adeno memerlukan adenovirus atau virus herpes simpleks untuk perbanyakannya. Tanpa virus penolong, genom hanya terintegrasi ke genom inang tetapi tidak tereskpresikan.

Rapid Test Parvo Virus adalah test kit untuk mendeteksi antigen Canine Parvovirus pada anjing. Ulasan singkat : Canine parvo virus adalah virus yang menyerang pada saluran pencernaan anjing yang menyebabkan muntah dan diare. Diare sering menimbulkan bau yang kuat dan anjing menampakkan geja klinis dalam waktu 7-10 hari pada infeksi

awal. Parvo Virus ini sangat kuat, dapat hidup ekstrim pada suhu panas dan dibawah nol untuk waktu yang sangat lama. Menyebabkan kematian pada anjing atau anak anjing yang tidak di vaksin. Spesifikasi Produk : • Prinsip: Immunochromatographic assay using Direct Sandwich Method • Tujuan: Mendeteksi antigen parvovirus pada anjing • Spesimen: Feces anjing • Waktu pembacaan: 5-10 menit • Sensitivitas dan spesifisitas tinggi • Tidak ada cross reaction • Kemasan: 1 test kit lengkap dari 1 box isi 10 (Harga perbox Rp 800.000)

Aplikasi Mendeteksi virus pada feses anjing Cara penggunaan Rapid Test Parvo Virus: 1 ) Mengambil specimen dari feses anjing dengan menggunakan swab. 2 ) Masukkan dan putar swab ke dalam tabung yang berisi 1ml diluent . 3 ) Campur sampel dengan diluent untuk mendapatkan ekstrak yang baik . 4 ) Keluarkan Device dari kantung alluminium foil , dan menempatkannya pada permukaan yang datar dan kering . 5 ) Dengan menggunakan dropper pipet sekali pakai yang disediakan, ambil sampel dari ekstrak tersebut . 6 ) Tambahkan empat tetes sampel tersebut ke dalam lubang device secara tepat dan perlahan tetes demi tetes 7 ) Ketika tes mulai bekerja , Anda akan melihat warna merah keunguan bergerak melintasi lubang jendela penunjuk

hasil di tengah perangkat tes . Jika migrasi belum muncul setelah 1 menit , tambahkan satu tetes ekstrak untuk menambah sampel. . 8 ) Menunggu hasil tes pada 5 ~ 10 menit . Jangan memutuskan setelah 20 menit . Pembacaan Hasil Rapid Tes Parvo Virus 1 ) Hasil Negatif Hanya muncul satu pita dalam membran dalam menunjukkan hasil negatif . 2 ) Hasil Positif Muncul dua garis warna ( ” T ” dan ” C ” ) pada membran, tidak pengaruh garis yang muncul pertama, menunjukkan hasil yang positif . 3 ) Hasil tidak valid Jika garis warna ungu tidak terlihat dalam membran device setelah melakukan tes , hasilnya dianggap tidak valid, atau tes mungkin telah rusak. Disarankan bahwa spesimen akan kembali diuji

RINGKASAN

:

Di dalam setiap famili, subdivisi disebut genera yang biasanya berdasarkan pada perbedaan serologi dan fisikokimia. Kriteria yang digunakan untuk mendefinisikan genera bervariasi dari famili ke famili. Nama genus mempunyai akhiran –virus. Pada 4 famili (Poxviridae, Herpesviridae,

Parvoviridae, Paramyxoviridae), kelompok besar yang disebut sub famili didefinisikan dengan mempertimbangkan kompleksitas hubungan di antara anggota virus. Jenis – jenis virus digunakan untuk mengelompokkan famili virus yang memiliki karakter yang umum. Hanya 1 jenis saat ini yang telah didefinisikan, yaitu Famili Mononegavirales, meliputi famili Filoviridae, Paramyxoviridae, dan Rhabdoviridae.

LATIHAN PEMAHAMAN

:

1. Sebutkan contoh virus DNA dan RNA berdasarkan Asam Nukleatnya ! a) Virus DNA, contohnya: 

Poxvirus



Hepesviruses



Adenoviruses



Papovaviruses



Parvoviruses

b) Virus RNA, contohnya:  Orthomyxoviruses  Paramyxoviruses  Rhabdoviruses  Picornaviruses  Togaviruses  Reoviruses  Retroviruses 2. sebutkan macam-macam virus berdasarkan sel inangnya ! Berdasarkan sel Inangnya, virus dibedakan menjadi: 1) Virus yang menyerang manusia, contoh HIV 2) Virus yang menyerang hewan, contoh rabies 3) Virus yang menyerang tumbuhan, contoh TMV 4) Virus yang menyerang bakteri, contoh virus T 3. Bagaimana cara penularan Adenovirus ?

Adenovirus ditularkan melalui kontak langsung, transmisi fekal-oral, dan melalui air. Beberapa jenis adenovirus mampu membangun infeksi asimtomatik

persisten

di

amandel,

kelenjar

gondok,

dan

usus.

Pengenyahan virus dapat terjadi selama berbulan-bulan atau tahun setelah infeksi awal. 4. Bagaimana gejala awal dari herpes genital ? Gejala awal dari herpes genital, antara lain: • Rasa gatal dan terbakar di daerah genital atau anal • Rasa sakit sekitar kaki, pantat atau daerah genital • Keluarnya cairan dari vagina • Adanya perasaan seperti tertekan di daerah perut 5. Jelaskan penggolongan virus berdasarkan bentuk dasarnya! Berdasarkan Bentuk Dasarnya, virus dibedakan menjadi: a. Virus bentuk Ikosahedral Yaitu bentuk virus tata ruang yang dibatasi oleh 20 segitiga sama sisi, dengan sumbu rotasi ganda, contohnya virus polio dan adenovirus. b. Virus bentuk Heliks Yaitu menyerupai batang panjang, nukleokapsid merupakan suatu struktur yang tidak kaku dalam selaput pembungkus lipoprotein yang berumbai dan berbentuk heliks, memiliki satu sumbu rotasi. Pada bagian atas terlihat RNA virus dengan kapsomer, misalnya virus influenza, TMV. c. Virus bentuk Kompleks Yaitu struktur yang amat kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. Contoh virus pox (virus cacar) yang mempunyai selubung yang menyelubungi asam nukelat.

LATIHAN PENERAPAN

:

1. Pernyataan berikut ini merupakan keterangan tentang struktur DNA dan RNA 1.terletak dalam inti sel 2. rantai panjang dan ganda 3. kadarnya berubah-rubah menurut laju sintesis protein 4.mengandung pirimidin : sitosin dan urasil 5. mengandung purin: adenin dan guanin 6. komponen gula : ribosa Pernyataan yang merupakan struktur DNA adalah : a. 1, 2, dan 4 b. 1, 2, dan 5 c. 1, 4, dan 6 d. 1, 5, dan 6 e. 2, 5, dan 6 2. Berikut ini tahapan sintesis protein: 1. RNAt membawa asam amino yang sesuai dengan kodon 2. Asam amino berderet-deret sesuai dengan kodon 3. RNAd meninggalkan inti menuju ribosom 4. DNA membentuk RNA duta 5. RNAt bergabug dengan RNAd di ribosom Urutan tahapan sintesis protei yang benar adalah... A. 1-2-3-4-5 B. 2-3-4-5-1 C. 3-1-2-5-4 D. 4-3-1-5-2 E. 5-4-3-2-1

3. Di bawah ini adalah tahap-tahap sintesis protein : 1. DNA membentuk RNA duta di dalam inti sel 2. Asam-asam amino diangkut oleh tRNA dari sitoplasma

3. RNA duta keluar dari inti sel 4. Terbentuk polipeptida 5. Asam-asam amino terangkai di dalam ribosom Urutan tahapan sintesis protein adalah.. A. 1-2-3-4-5 B. 1-3-2-4-5 C.

1-3-2-5-4

D. 2-3-1-4-5 E. 2-4-5-1-3 4. Salah satu fungsi DNA adalah menyusun protein. Sintesis ini terjadi di dalam ribosom. Mekanisme sintesis protein ini berturut-turut dari asam nukleat, DNA dan RNA dapat dinyatakan sebagai berikut: A.

DNA– RNAt – RNAd

B.

RNAd – DNA – RNAt

C.

DNA – RNAd – RNAt

D. RNAt – RNAd – DNA E.

RNAd – RNAt – DNA

5. Perhatikanlah ciri – ciri ADN dan ARN di bawah ini! I Pirimidin : U – S ;Rantai : Tunggal ;Gula : Pentosa ;Purin :A – G ;Kadar: Bergantung pada sintesis protein II Pirimidin :A – T ;Rantai : Ganda ;Gula : Ribosa ;Purin :G – S ;Kadar:

Bergantung pada sintesis protein III Pirimidin :T – S ;Rantai : Ganda ;Gula : Deoksiribosa ;Purin :A – G ;Kadar: Tidak dipengaruhi sintesis protein IV Pirimidin :U – A ;Rantai : Tungal ;Gula : Deoksiribosa ;Purin :G – T ;Kadar: Tidak dipengaruhi sintesis protein. Yang merupakan ciri –ciri ARN dan AND adalah… A. I dan II B. II dan III C. I dan IV D. I dan III E. II dan IV

6. Dilihat dari bentuk dan letaknya, perbedaan yang tepat antara DNA dan RNA adalah.. A.

DNA : Rantai pendek, ganda, dan berpilin RNA : Rantai panjang, tunggal, dan tidak berpilin

B. DNA : Rantai pendek, tunggal, dan berpilin RNA : Rantai panjang, ganda, dan tidak berpilin C.

DNA : Rantai panjang, ganda dan berpilin RNA : Rantai pendek, tunggal dan tidak berpilin

D. DNA: Rantai panjang, tunggal dan berpilin RNA : Rantai pendek, ganda dan tidak berpilin E. DNA :Rantai panjang, ganda, dan tidak berpilin RNA : Rantai pendek, tunggal, dan berpilin

GLOSARIUM

1. Adeno Associated Virus (AAV) adalah virus kecil yang menginfeksi manusia dan beberapa spesies primata lainnya. Virus ini menyebabkan respon imun yang sangat ringan, memberikan dukungan lebih jauh terhadap kurangnya patogenisitasnya. 2. Adenoviruses adalah grup virus yang dapat menyebabkan infeksi pada mata, usus, paru, dan saluran napas. 3. Beet Yellow Virus (BYV) adalah virus kuning telur ditularkan oleh beberapa spesies kutu daun dan menyebabkan penyakit menguning pada vulgaris Beta dan Spinacia oleracea. 4. Canine parvovirus (CPV) adalah virus menular yang terutama menyerang anjing, dan diperkirakan berasal dari kucing. 5. DNA adalah sebuah polimer yang terdiri dari satuan-satuan berulang yang disebut nukleotida. Tiap-tiap nukleotida terdiri dari tiga komponen utama, yakni gugus fosfat, gula deoksiribosa, dan basa nitrogen (nukleobasa). Pada DNA, nukleobasa yang ditemukan adalah Adenina (A), Guanina (G), Sitosina (C) dan Timina (T). 6. Faline panleukopenia virus adalah infeksi virus yang menyerang kucing, baik kucing liar maupun peliharaan. 7. Gastroenteritis adalah infeksi pada usus atau perut yang disebabkan oleh beberapa jenis virus dan bakteri. 8. Herpesvirus adalah penyakit infeksi yang menyerang organ kulit yang disebabkan oleh virus Herpes simpleks. Herpes sangat populer di masyarakat sebagai penyakit menular seksual, padahal herpes juga dapat mengenai kulit bagian lainnya bahkan organ dalam tubuh. Infeksi herpes yang mengenai kulit sekitar wajah di sering disebut sebagai cold sores. 9. HIV adalah singkatan dari Human Immunodeficiency Virus. Virus ini menyerang sistem kekebalan tubuh dan melemahkan kemampuan tubuh untuk melawan infeksi dan penyakit. HIV belum bisa disembuhkan, tapi ada

pengobatan yang bisa digunakan untuk memperlambat perkembangan penyakit. 10. HPV adalah singkatan dari Human papillomavirus adalah virus yang dapat menyebabkan tumbuhnya kutil di berbagai bagian tubuh. Tidak semua HPV menyebabkan kanker. 11. Kapsomer adalah rantai protein yang sangat panjang (Polipeptida) 12. Maligna atau ganas mengacu pada sifat penyakit dimana sekelompok sel tumbuh tidak terkendali, menginvasi dan merusakan jaringan di sekitarnya, dan kadang-kadang metastasis (menyebar ke lokasi lain di tubuh melalui getah bening). 13. Orthomyxoviruses adalah famili virus RNA yang meliputi lima genera: Influenzavirus A, Influenzavirus B, Influenzavirus C, Thogotovirus dan Isavirus. Tiga genera pertama dapat menyebabkan influenza pada vertebrata, termasuk burung (lihat juga flu burung), manusia dan mamalia lainnya. 14. Paramyxoviruses adalah keluarga virus yang memiliki genom RNA utas negatif dan tidak bersegmen. Karakteristik virus ini adalah memiliki amplop yang tersusun dari lipoprotein yang menyelubungi nukleokapsid yang berbentuk heliks.Paramyxoviridae ditemukan hanya pada hewan berdarah panas. 15. Picornaviruses adalah virus milik keluarga Picornaviridae, keluarga virus dalam urutan Picornavirales. Vertebrata, termasuk manusia, berfungsi sebagai penghuni alami. 16. Rabies adalah penyakit infeksi tingkat akut pada susunan saraf pusat yang disebabkan oleh virus rabies. Penyakit ini bersifat zoonotik, yaitu dapat ditularkan dari hewan ke manusia. Virus rabies ditularkan ke manusia melalu gigitan hewan misalnya oleh anjing, kucing, kera, rakun, dan kelelawar. 17. Reoviruses adalah virus berukuran sedang dengan genom RNA untai ganda yang bersegmen. Familinya mencakup rotavirus manusia, penyebab paling pentingdari gastroenteritis anak-anak di seluruh dunia. 18. Retrovirus adalah salah satu golongan virus yang terdiri dari satu benang tunggal RNA (bukannya DNA).

19. Retroviruses adalah salah satu golongan virus yang terdiri dari satu benang tunggal RNA (bukannya DNA). Setelah menginfeksi sel, virus tersebut akan membentuk replika DNA dari RNA-nya dengan menggunakan enzim reverse transcriptase. 20. Rhabdoviruses adalah virus yang menyebabkan penyakit rabies atau lebih dikenal dengan penyakit anjing gila (soeparman,1987). Rabies merupakan infeksi akut dari susunan saraf pusat yang berakibat fatal. 21. RNA adalah molekul polimer yang terlibat dalam berbagai peran biologis dalam mengkode, dekode, regulasi, dan ekspresi gen. ... Banyak virus mengkodekan informasi genetik mereka menggunakan genom RNA. 22. TMV (Tobacco Mozaic Virus) adalah virus yang menyebabkan penyakit pada tembakau dan tumbuhan anggota suku terung-terungan (Solanaceae) lain. Gejala yang ditimbulkan adalah bercak-bercak kuning pada daun yang menyebar, seperti mosaik. 23. Togaviruses adalah virus yang hospesnya dari Manusia, mamalia, burung, dan nyamuk (vector). Togavirus mempunyai banyak anggota virus yang termaksud dalam serangga penghisap darah dan ditularkan kepada vertebrata oleh gigitan serangga tersebut. atas dasar antigen yang dapat ditunjukan dengan tes-tes netralisasi, HI dan fiksasi complement, togovirus dikelompokan menjadi 3 genus yaitu genus alphavirus ( arbovirus grup A ), Flavivirus ( arbovirus grup B ), dan rubivirus. 24. Verruciformis epidermodysplasia adalah penyakit langka yang diwariskan dan ditandai dengan kerentanan terhadap infeksi tak biasa dengan jenis tertentu dari human papilomavirus. Ini juga menyebabkan kecenderungan menyebabkan tumor kulit ganas. Cacat parsial dalam imunitas yang diperantarai sel telah dibuktikan dalam penyakit ini. 25. Virus Influenza adalah penyakit menular yang disebabkan oleh virus RNA dari familia Orthomyxoviridae (virus

influenza),

yang

menyerang unggas dan mamalia. Gejala yang paling umum dari penyakit ini adalah menggigil, demam, nyeri tenggorokan, nyeri otot, nyeri kepala berat, batuk, kelemahan, dan rasa tidak nyaman secara umum.

26. Virus Poliomylitis adalah penyakit virus yang sangat mudah menular dan menyerang sistem saraf, khususnya pada balita yang belum melakukan vaksinasi polio. Pada kasus yang parah, penyakit ini bisa menyebabkan kesulitan bernapas, kelumpuhan, atau dan kematian. 27. Virus Vaccinia adalah virus besar yang kompleks dan terselubung milik keluarga poxvirus. Ini memiliki genom DNA berantai linier berganda sekitar 190 kbp, dan yang mengkodekan sekitar 250 gen. Dimensi virion kira-kira 360 × 270 × 250 nm, dengan massa kira-kira 5-10 fg 28. Virus adalah parasit mikroskopik yang menginfeksi sel organisme biologis. Virus bersifat parasit obligat, hal tersebut disebabkan karena virus hanya dapat bereproduksi di dalam material hidup

dengan menginvasi dan

memanfaatkan sel makhluk hidup karena virus tidak memiliki perlengkapan seluler untuk bereproduksi sendiri. Biasanya virus mengandung sejumlah kecil asam nukleat (DNA atau RNA, tetapi tidak kombinasi keduanya) yang diselubungi

semacam

bahan

pelindung

yang

terdiri

atas protein, lipid, glikoprotein, atau kombinasi ketiganya.

BAGIAN 4

SUB TOPIK/SUB JUDUL

: BAKTERIOFAGE

TUJUAN INSTRUKSIONAL

: Mampu melakukan pemeriksaan bakteriofage

INDIKATOR

: Mampu melakukan pemeriksaan bakteriofaga dengan metode plaque

URAIAN MATERI: Virus adalah partikel nukleoprotein yang berukuran sub mikroskopis, memperbanyak diri dalam jaringan sel hidup, dan mempunyai kemampuan menyebabkan penyakit pada makhluk hidup (Hatano et al., 2010). Menurut Deri (2008), virus bersifat virulen dan hanya mampu hidup pada organisme yang

hidup. Virus hanya memiliki DNA atau RNA saja. Virus disebut benda hidup karena mempunyai DNA atau RNA dan dapat bereproduksi. Ukuran virus lebih kecil dari bakteri yakni sekitar 200-300 milimikron. Bentuk virus ada yang poligonal, bulat, T. Contoh virus berbentuk T adalah bakteriofage atu sering disebut fag saja. Virus ini menyerang bakteri epidemik misalnya Eschericia coli . Bakteriofag/ phage (Ф) merupakan virus yang menginfeksi bakteri, yang menyebabkan bakteri lisis dan mati setelah bakteriofag berkembang biak di dalam bakteri dan keluar dari bakteri dengan jumlah yang sangat banyak. Virulent phage (bakteriofag yang eksklusif mengakibatkan lisis) memiliki banyak keuntungan sebagai biokontrol maupun agen terapi karena kemampuannya dalam menyerang bakteri dan tidak mempunyai pengaruh terhadap jenis sel lain termasuk sel manusia, hewan dan tanaman. Jika pada bakteri yang dihitung adalah banyaknya koloni sedangkan pada bakteriofag adalah terbentuknya plaque. Plaque yang terbentuk dihitung dengan satuan PFU/mL (Plaque Forming Unit/mL) (Nindita et. al., 2013) Bakteriofage merupakan virus yang menyerang bakteri secara langsung atau mengintegrasikan DNA virus ke dalam kromosom bakteri inang (Buana, 2014). Bakteriofage termasuk ke dalam ordo Caudovirales. Salah satu contoh bakteriofage adalah T4 virus yang menyerang bakteri Eschericia coli. E. coli merupakan bakteri yang hidup pada saluran pencernaan manusia. Bakteriofage memiliki sebuah inti asam nukleat dikelilingi oleh selubung protein atau kapsid. Kapsid tersusun dari subunit-subunit morfologis yang disebut kapsomer. Kapsomer terdiri dari sejumlah subunit atau molekul protein yang disebut protomer. Fage mempunyai simetri kubus atau helical. Fage kubus adalah benda padat teratur, sedangkan fage helical berbentuk batang. Pada umumnya bakteriofage kepalanya polyhedral tetapi ekornya berbentuk batang (Azizi, 2015). Salah satu prosedur penting dalam virologi adalah mengukur konsentrasi virus dalam sampel. Menentukan jumlah banyaknya virus yang menginfeksi yaitu banyak digunakan dengan test plaque atau zona jernih. Metode ini dikembangkan pada tahun 1952 digunakan dalam virologi hewan, dan pertama kali dikembangkan untuk menghitung banyaknya bakteriofage. Teknik ini menujukan

penyebab virus progeni yang ditandai dengan zona lingkar sel (Dulbecco, 1953). Kelebihan metode plaque adalah metode yang sederhana, mudah dilakukan dan biayanya terjangkau. Namun, penghitungan jumlah virus yang menginfeksi tidak spesifik dikarenakan hanya diasumsikan bahwa satu zona jernih adalah satu virus. Kekurangan metode plaque adalah tidak dapat mendeteksi jenis virus yang ada pada media NA (Suryati, 2007).

ALAT dan BAHAN Alat yang digunakan pada acara praktikum ini adalah 

Bunsen



Tabung reaksi



Cawan perti



Erlenmeyer



Tube eppendorf 1 ml



Sentrifugator



Milipore



Flask milipore 0,45 µm. Bahan yang digunakan pada acara praktikum ini adalah



Sampel kotoran sapi 1 gr



Akuades



Media Luria Bertani semi solid



Phospat Buffer Saline (PBS)



Isolat cair Escherichia coli.

PROSEDUR PEMERIKSAAN A. Pengkayaan bakteriofage : 1. Tabung Erlenmeyer,

sampel kotoran sapi 1 gr, medium LB (Luria

Bertani) semi solid 80 ml dan isolat Escherichia coli cair disiapkan.

2. Konsorsium dibuat dengan sampel kotoran sapi sebanyak 1 gr dari 4 kelompok diencerkan dengan 9 ml akuades dalam keadaan aseptis, diambil 10 ml kemudian dituang ke dalam tabung Erlenmeyer, kemudian ditambahkan 10 ml inokulum Escherichia coli dan 80 ml media Luria Bertani. 3.

Konsorsium diinkubasi selama 2 x 24 jam dengan suhu 37◦C.

B. Isolasi bakteriofage : 1. Tube eppendorf, konsorsium, bunsen, mikropipet dan tip, sentrifugator, cawan petri, Phospate Buffer Saline (PBS), isolat Escherichia coli cair, dan media LB disiapkan. 2. Konsorsium dipindahkan ke dalam 10 buah Eppendorf masing-masing 1 ml menggunakan mikropipet dan tip, kemudian disentrifugasi 2000 rpm selama 5 menit. Konsorsium dimasukkan di dalam tube eppendorf 1 ml. 3. Supernatan dari tube eppendorf diambil kemudian disaring dengan milipore menggunakan flask milipore 0,45 µm. 4. Dilakukan pengenceran bertingkat sampai 10-5 dengan memindahkan 0,1 ml filtrat bakteriofage setiap pengenceran ke eppendorf berisi 0,9 ml PBS, lalu dihomogenkan. 5. Dua pengenceran terakhir diambil masing-masing 0,1 ml dan ditambahkan 0,5 Escherichia coli dimasukkan ke tube eppendorf berbeda sebagai suspensi faga, kemudian diinkubasi 10 menit dengan suhu 37⁰C. Masingmasing suspensi faga 1 ml dimasukkan ke dalam media LB semi solid, dihomogenkan, diplatting, kemudian diinkubasi 3 x 24 jam dengan suhu 37⁰C. C. Perhitungan plaque : 1. Plaque yang terbentuk pada kedua pengenceran diamati, apabila terbentuk plaque pada koloni bakteri maka diduga terdapat virus yang melisiskan sel bakteri. 2. Plaque dihitung jumlahnya dengan rumus: PFU’s ml

=

Plaque dilution x volume

HASIL dan PEMBAHASAN

Tabel 1. Hasil Pengamatan Virus pada Bakteri dengan Metode Plaque

No

Jumlah Plaque (PFU’s/ml) 10-2 = 0 10-3 = 0 10-2 = 9 x 103 10-3 = 12 x 104 10-2 = 1 x 103 10-3 = 0 10-2 = 0 10-3 = 656 x 104 Tabel 1

1

Kelompok/Rombongan 1/III

2

2/ III

3

3/ III

4

4/ III

Berdasarkan tabel Hasil Pengamatan Virus pada Bakteri dengan Metode Plaque yaitu bahwa untuk menguji adanya bakteriofage dapat digunakan metode Plaque. Hal ini dapat teramati pada hasil kelompok 1 menunjukan negatif pada kedua pengenceran. Hasil yang diperoleh dari kelompok 2 menunjukan positif pada kedua pengenceran dengan 10-2 yaitu 9 x 103 dan 10-3 yaitu 12 x 104, pada kelompok 3 hasil positif ditunjukan pada pengenceran 10-2 yaitu 1 x 103, sedangkan pada kelompok 4 hasil menunjukan positif pada pengenceran 10-3 yaitu 656 x 104. Menurut Smith, (1980) penghitungan jumlah virus yang menginfeksi tidak spesifik, dikarenakan hanya diasumsikan bahwa satu zona jernih adalah satu virus.

Gambar 1. Hasil uji 10-2

Gambar 2. Hasil uji 10-3

Hasil uji pengamatan virus pada bakteri dengan metode plaque Gambar 2 dan 3 pada bakteri Escherichia coli adalah positif. Hal ini menunjukkan bahwa plaque akan terlihat pada sel-sel yang mati atau rusak. Menurut Buana (2014), bahwa bakteriofage merupakan virus yang menginfeksi bakteri dan mampu membunuh sel bakteri secara langsung atau mengintegrasikan DNA virus ke dalam kromosom bakteri inang, sehingga akan terbentuk plaque atau zona jernih. Kaufmann, (2002) berpendapat bahwa metode plaque digunakan untuk menentukan jumlah unit pembentuk plaque dalam sampel virus yang merupakan salah satu ukuran kuantitas virus. Uji ini didasarkan pada metode mikrobiologi yang dilakukan dalam cawan petri.

RINGKASAN

:

Adanya virus yang melisiskan sel bakteri yang terlihat dari terbentuknya zona jernih atau adanya plaque yang terbentuk di dalam media LB yang telah diinokulasi sampel dan bakteri Escherichia coli.

LATIHAN PEMAHAMAN

:

1. Bakteriofaga adalah… 2. Virulen phage adalah…. 3. Kelebihan metode plaque adalah…. 4. Sebutkan contoh sampel untuk pemeriksaan bakteriofage 5. Media yang digunakan untuk pemeriksaan bakteriofaga adalah…

GLOSARIUM

1. Asam nukleat: pembawa informasi genetika. 2. Bakteriofage: virus yang menginfeksi bakteri. 3. Daur lisogenik: daur hidup pada virus yang tidak mengakibatkan hospes pecah atau mati tapi hanya ditempeli dan virus ikut membelah jika inangnya membelah. 4. Daur litik: daur hidup pada virus yang mengakibatkan hospes pecah/mati. 5. Hospes: Inang. 6. Kapsid: selubung virus yang tersusun atas protein. 7. Kapsomer: suatu unit protein penyusun kapsid. 8. Replikasi: proses penggandaan asam nukleat (DNA). 9. Reproduksi: perkembangbiakan. 10. Vaksin: patogen yang telah dilemahkan. 11. Vaksinasi:

pemberian

antigen

suatu

penyakit

sehingga

tubuh

menghasilkan antibodi terahadapnya. Hal ini membangkitkan sistem kekebalan tubuh terhadap penyakit tersebut. 12. Virion: partikel virus yang lengkap, terdiri atas bahan genetik (DNA atau RNA) yang dikelilingi selubung protein (dan terkadang juga ada bahanbahan lain). 13. Virus: partikel hidup paling kecil yang berdiameter antara 1,025 sampai 0,25 mikron

BAGIAN 5

SUB TOPIK/SUB JUDUL BAB :

Vaksin Virus

TUJUAN INSTRUKSIONAL

Mampu melakukan

:

pemeriksaan,mengetahui keberhasilan vaksinasi untuk mengetahui tingkat

keberhasilan vaksinasi maka melakukan uji serologis dapat dilakukan pada 2-3 minggu post vaksinasi aktif atau 3-4 minggu post vaksinasi Inaktif.

INDIKATOR

:

Kemampuan melakukan identifikasi dan laporan hasil praktikum.

URAIAN MATERI

:

A. Vaksin Polio Vaksinasi polio dapat diberikan secara oral ( OPV ) maupun suntikan ( IPV ). Vaksin rutin digunakan sejak bayi lahir sebagai dosis awal.Bibit penyakit yang menyebabkan polio adalah virus, vaksin yang digunakan oleh banyak negara termasuk Indonesia adalah vaksin hidup, berbentuk cairan.Penyakit poliomyelitis adalah penyakit yang disebabkan oleh virus polio.Virus polio sangat menular, disebarkan melalui makanan atau dari mulut ke mulut.Penyakit polio menimbulkan kelumpuhan anggota badan bagian bawah pada anak.Polio juga bisa menyebabkan peradangan pada selaput otak.Dan vaksinasi polio dapat mencegah penyakit poliomyelitis. TUJUAN Memicu antibody dalam darah sehingga menghasilkan pertahanan lokal terhadap virus polio liar. USIA DAN JUMLAH PEMBERIAN Vaksinasi polio wajib diberikan yaitu pada saat anak lahir dan selanjutnya diberikan tiga dosis berturut-turut dengan jarak 6-8 minggu.Jenis vaksinasi polio dibagi menjadi dua polio hidup yang diberikan lewat mulut (OPV) dan vaksin polio mati yang disuntikkan (IPV). Tetapi vaksin polio yang dianjurkan adalah polio hidup yang diberikan melalui mulut dengan dosis 2 tetes ( 0,1 ml ), bila dalam 10 menit di muntahkan, maka dosis tersebut perlu di ulang. Vaksinasi polio yang disuntikkan diberikan 0,5 ml subkutan dalam tiga kali pemberian berturutturut dalam jarak 2 bulan masing-masing dosis. Perlindungan mukosa selaput usus yang ditimbulkan IPV lebih rendah daripada OPV.

PERSIAPAN 1. Persiapan alat 

Handscoon



Vaksin polio



Pipet plastic



Pinset



Bengkok

PELAKSANAAN 1. Mengucapkan salam 2. Mencuci tangan 3. Membuka tutup karet plakon vaksin polio 4. Memasang pipet plastic pada plakon 5. Mengatur posisi bayi 6. Membuka mulut bayi dengan menggunakan 2 jari 7. Meneteskan vaksin polio langsung dari pipet kedalam mulut sebanyak 2 tetes. 8. Merapikan bayi 9. Memberikan penjelasan sehubungan dengan hasil vaksinasi dan efek samping vaksinasi. 10. Memberi tahu jadwal vaksinasi selanjutnya 11. Merapikan alat 12. Mencuci tangan 13. Melakukan dokumentasi EFEK SAMPING Seperti sediaan obat lainnya, vaksin polio berisiko menimbulkan efek samping baik ringan maupun berat, namun resiko ini sangat kecil dibandingkan dengan jika menderita poliomyelitis.Setelah pemberian vaksin dapat mengalami gejala pusing, diare ringan, dan nyeri otot, namun sangat jarang.Bila anak sedang diare ada kemungkinan vaksin tidak bekerja dengan baik karena ada gangguan penyerapan vaksin oleh usus akibat diare berat.Selain itu efek samping yang mungkin terjadi adalah dapat berupa kejang-kejang, tetapi kemungkinan tersebut

sangat kecil untuk terjadi. Pada kasus poliomyelitis yang berkaitan dengan vaksin pernah dilaporkan 1 dari 2,5 juta vaksin. Lumpuh layu setelah vaksin ini terjadi 430 hari setelah pemberian OPV dan 4-75 hari setelah kontak dengan penerima OPV.Hubungi dokter jika ada keluhan yang berat seperti demam tinggi dan gangguan prilaku atau tanda reaksi berat seperti sesak nafas, dan pusing sampai pingsan.

KONTRA INDIKASI Vaksin polio oral tidak boleh diberikan dalam keadaaan : 1. Ineksi HIV atau kontak dengan HIV serumah 2. Keadaan kekebalan tubuh yang rendah atau tinggal serumah dengan pasien yang memiliki kekebalan tubuh rendah seperti : terapi steroid jangka panjang, penyakit kanker, dakam kemoterapi. 3. Muntah atau diare berat, pemberian vaksin ditunda.

Vaksin polio suntik tidak boleh diberikan dalam keadaan : 1. Adanya alergi terhadap neomisin, streptomisin dan polimiksin-B

B. VAKSIN HEPATITIS B Vaksin hepatitis B adalah vaksin virus recombinant yang telah dimatikan dan bersifat reninfactorie / non-infecious, berasal dari HBsAg yang dihasilkan dalam sel ragi (Hansenula polymorpha) menggunakan teknologi DNA rekombinan. (vademecum Bio Farma Jan 2002).Hepatitis B (penyakit kuning) adalah penyakit yang disebabkan oleh virus hepatitis B yang merusak hati.Penyakit ini bisa menjadi kronis dan menimbulkan pengerasan hati (Cirrhosis Hepatis), kanker hati (Hepato Cellular Carsinoma) dan menimbulkan kematian.Infeksi pada anak biasanya tidak menimbulkan gejala. Kemasan: •

Vaksin hepatitis B adalah vaksin yang berbentuk cairan.

•

Vaksin hepatitis B terdiri dari dua kemasan:

- kemasan dalam prefiil injection device (PID) - kemasan dalam vial •

Satu box vaksin hepatitis B PID terdiri dari 100 HB PID.

•

Satu box vaksin hepatitis B vial terdiri dari 10 vial @ 5 dosis masing-

masing TUJUAN Untuk mendapatkan kekebalan aktif terhadap penyakit hepatitis B. Pemberian vaksin bagi bayi pada awal masa kehidupannya sangat penting untuk mencegah berbagai penyakit berbahaya. Salah satu yang paling penting untuk diberikan adalah vaksinasi hepatitis B. Dari pengidap hepatitis kronik yang berada di masyarakat, sekitar 90 persen di antaranya mengalami infeksi mereka masih bayi. Infeksi dari ibu yang mengidap virus hepatitis bisa terjadi sejak masa persalinan hingga bayi mencapai usia balita Penularan virus Hepatitis B pada bayi bukan didapat dari darah bayi yang terhubung kepada ibu melalui plasenta bayi atau dari air susu ibu . Tapi bisa terjadi saat persalian atau juga ketika menyusui di mana terjadi kontak antara luka kecil pada puting susu ibu dengan mulut bayi. Untuk mencegah penularan ini, setiap bayi diwajibkan mendapat vaksin hepatitis B pada usia 0-7 hari.

EFEKTIVITAS VAKSIN Pemberian 3 dosis vaksin Hepatitis B secara intramuskluar menginduksi respon antibodi protektif pada lebih dari 90% dewasa sehat yang berusia kurang dari 40 tahun. Setelah berusia 40 tahun, imunitas berkurang dibawah 90%, dan saat berusia 60 tahun hanya 65-76% vaksin yang mempunyai efek proteksi terhadap infeksi virus Hepatitis B. Meskipun faktor pejamu lainnya seperti merokok, obesitas, infeksi HIV, dan penyakit kronik menyebabkan imunogenisitas vaksin yang rendah, tetapi usia merupakan factor determinan terpenting. JADWAL PEMBERIAN o Saat lahir :

HB-1 harus diberikan dalam waktu 12 jam setelah lahir, dilanjutkan pada umur 1 dan 6 bulan. Apabila status HbsAg-B ibu positif, dalam waktu 12 jam setelah lahir diberikan HBlg 0,5 ml bersamaan dengan vaksin HB-1. Apabila semula status HbsAg ibu tidak diketahui dan ternyata dalam perjalanan selanjutnya diketahui bahwa ibu HbsAg positif maka masih dapat diberikan HBlg 0,5 ml sebelum bayi berumur 7 hari. o 1 bulan : Hb-2 diberikan pada umur 1 bulan, interval HB-1 dan HB-2 adalah 1 bulan. o 6 bulan : HB-3 diberikan umur 6 bulan. Untuk mendapatkan respons imun optimal, interval HB-2 dan HB-3 minimal 2 bulan, terbaik 5 bulan

CARA PENULARAN 1. Vertikal 

Penularannya langsung dari ibu ke anak pada kehamilan/persalinan dan pasca persalinan.

2. Horizontal 

Penularannya dari orang sakit ke orang yang sehat. Virus Hepatitis B dapat ditransmisikan dengan efektif melalui cairan tubuh, perkutan, dan melalui membran mukosa. Penularan yang lebih rendah dapat terjadi melalui kontak dengan karier Hepatitis B, hemodialisis, paparan terhadap pekerja kesehatan yang terinfeksi, alat tato, alat tindik, hubungan seksual, dan inseminasi buatan. Selain itu penularan juga dapat terjadi melalui transfusi darah dan donor organ. Hepatitis B dapat menular melalui pasien dengan HBsAg yang negatif tetapi antiHBc positif, karena adanya kemungkinan DNA virus Hepatitis B yang bersirkulasi, yang dapat dideteksi dengan PCR (10-20% kasus).Virus Hepatitis B 100 kali lebih infeksius pada pasien dengan infeksi HIV dan 10 kali lebih infeksius pada pasien Hepatitis C. Adanya HBeAg yang positif mengindikasikan risiko transmisi virus yang tinggi.

DOSIS DAN CARA PEMBERIAN 1. Pemberian sebanyak 3 dosis 2. Dosis pertama diberikan pada usia 0-7 hari, dosis berikutnya dengan interval minimal 4 minggu ( 1 bulan ) 3. Vaksin disuntikkandengan dosis 0,5 ml, pemberian secara IM, sebaiknya pada antero lateral / paha. 4. Sebelum digunakan vaksin harus dikocok dengan memegang botol terlebih dahulu agar suspensi menjadi homogen. Buka kantong aluminium / plastic dan keluarkan alat suntik PID. 5. Pegang alat suntik PID pada leher dan tutup jarum dengan memegang keduanya diantara jari telunjuk dan jempol dengan gerakan cepat dorong tutup jarum kearah leher. Dorong sampai tidak ada jarak antara tutup jarum dan leher. 6. Buka tutup jarum, tetap pasang alat suntik pada bagian leher dan tusukkan jarum pada antero lateral paha secara IM ( tidak perlu aspirasi ). 7. Pijat reserrior dengan kuat untuk menyuntik setelah reservoir kempis, cabut alat suntik.

KONTRA INDIKASI Hipersensitif terhadap komponen vaksin. Sama halnya seperti vaksin-vaksin lain, vaksin ini tidak boleh diberikan kepada penderita infeksi berat disertai kejang.

EFEK SAMPING Reaksi lokal seperti rasa sakit, kemerahan dan pembengkakan di sekitar tempat penyuntikan.Reaksi yang terjadi bersifat ringan dan biasanya hilang setelah 2 hari.Vaksinasi hepatitis B juga dapat menggunakan vaksin DPT-HB atau biasa disebut dengan combo.

C. Vaksinasi campak

Vaksinasi yang diberikan untuk kekebalan aktif terhadap penyakit campak.Vaksin ini mengandung virus campak hidup yang dilemahkan. Freeze Died adalah sediaan dalam bentuk serbuk kering yang kemudian dilarutkan. Nama paten dari vaksin campak adalah virus trimbax dan vaksin MMR ( Measles. Mumps, Rubella, Vaceint ).Kemasan dalam flacon berbentuk gumpalan yang beku dan kering untuk dilarutkan dalam 5 cc pelarut. Sebelum menyuntikkan vaksin ini, harus terlebih dahulu dilarutkan dengan pelarut vaksin (aqua bidest). Disebut beku kering oleh karena pabrik pembuatan vaksin ini pertama kali membekukan vaksin tersebut kemudian mengeringkannya.Vaksin yang telah dilarutkan potensinya cepat menurun dan hanya bertahan selama 8 jam. TUJUAN Mendapatkan kekebalan terhadap penyakit campak secara aktif dan sebaiknya diberikan pada usia 9-11 bulan. Sebenarnya bayi sudah mendapatkan kekebalan campak dari ibunya. Namun seiring bertambahnya usia, antibodi dari ibunya semakin menurun sehingga butuh antibodi tambahan lewat pemberian vaksin campak. Apalagi penyakit campak mudah menular, dan mereka yang daya tahan tubuhnya lemah gampang sekali terserang penyakit yang disebabkan virus Morbili ini.Untungnya campak hanya diderita sekali seumur hidup. Jadi, sekali terkena campak, setelah itu biasanya tak akan terkena lagi.

PERSIAPAN 1. Persiapan Vaksin 

Cek label plakon kasian



Buka ampul / plakon yang diperlukan, sedot dalam pelarut spuit 1 cc. Masukkan pelarut dalam vaksin campak kocok sampai homogeny.



Spuit untuk aplus vaksin, tidak digunakan untuk menyuntik

2. Persiapan Bayi 

Dudukan bayi di pangkuan ibu



Lengan kanan bayi dilipat diketiak ibu



Ibu menopang kepala bayi



Tangan kiri ibu memegang tangan kiri bayi

3. Mengisi Spuit 

Ambil spuit 1 cc yang telah tersedia



Bersihkan tutup karet yang akan digunakan dengan kapas lembab



Isap 0,5 cc vaksin kedalam spuit



Spuit ditegakluruskan untuk melihat adanya gelembung udara, vaksin segera diberikan

KEKEBALAN

Memberikan daya proteksi vaksinasi campak sangat tinggi yaitu 96 % - 99 %.

USIA DAN JUMLAH PEMBERIAN

Sebanyak 2 kali; 1 kali di usia 9 bulan, 1 kali di usia 6 tahun. Dianjurkan, pemberian campak ke-1 sesuai jadwal. Selain karena antibodi dari ibu sudah menurun di usia 9 bulan, penyakit campak umumnya menyerang anak usia balita. Jika sampai 12 bulan belum mendapatkan vaksinasi campak, maka pada usia 12 bulan harus divaksinasi MMR (Measles Mump Rubella).

PELAKSANAAN

1. Tempat yang akan disuntikkan adalah lengan atas 2. Disenfeksi daerah tempat penyuntikkan 3. Jepitlah lengan yang akan disuntikkan dengan jari-jari 4. Masukkan jarum kedalam kulit dengan sudut 45o 5. Tekan pistonnya. Perlahan-lahan dengan vaksin sebanyak 0,5 cc 6. Cabut jarum dengan segera setelah vaksin habis dan tekan bekas suntikkan.

PENULARAN

Penularan campak terjadi lewat udara atau butiran halus air ludah (droplet) penderita yang terhirup melalui hidung atau mulut. Pada masa inkubasi yang berlangsung sekitar 10-12 hari, gejalanya sulit dideteksi.Setelah itu barulah muncul gejala flu (batuk, pilek, demam), mata kemerahabn dan berair, si kecilpun merasa silau saat melihat cahaya. Kemudian, disebelah dalam mulut muncul bintik-bintik putih yang akan bertahan 3-4 hari. Beberapa anak juga mengalami diare.satu-dua hari kemudian timbul demam tinggi yang turun naik, berkisar 38-40,5 derajat celcius. Seiring dengan itu barulah muncul bercak-bercak merah yang merupakan ciri khas penyakit ini.Ukurannya tidak terlalu besar, tapi juga tidak terlalu kecil.Awalnya haya muncul di beberapa bagian tubuh saja seperti kuping, leher, dada, muka, tangan dan kaki.Dalam waktu 1 minggu, bercak-bercak merah ini hanya di beberapa bagian tibih saja dan tidak banyak. Jika bercak merah sudah keluar, umumnya demam akan turun dengan sendirinya. Bercak merah pun akan berubah menjadi kehitaman dan bersisik, disebut hiperpigmentasi. Pada akhirnya bercak akan mengelupas atau rontok atau sembuh dengan sendirinya. Umumnya dibutuhkan waktu hingga 2 minggu sampai anak sembuh benar dari sisa-sisa campak.

EFEK SAMPING 

Sangat jarang terjadi kejang kemungkinan kejang ringan dan tidak berbahaya pada hari ke 10-12 setelah penyuntikkan



SPC ( subuole silencing panechepatitis )

KONTRA INDIKASI 

Anak yang sakit parah



Anak yang menderita TBC tanpa pengobatan



Difesiensi gizi gangguan kekebalan



Penderitaan penyakit atau sedang dalam pengobatan

LATIHAN PEMAHAMAN : 1. Berapa persen, daya proteksi campak tertinggi? Jawab : 96%-99% 2. Pada saat kapan, vaksin hepatitis diberikan? Jawab : o Saat lahir : HB-1 harus diberikan dalam waktu 12 jam setelah lahir, dilanjutkan pada umur 1 dan 6 bulan. Apabila status HbsAg-B ibu positif, dalam waktu 12 jam setelah lahir diberikan HBlg 0,5 ml bersamaan dengan vaksin HB-1. Apabila semula status HbsAg ibu tidak diketahui dan ternyata dalam perjalanan selanjutnya diketahui bahwa ibu HbsAg positif maka masih dapat diberikan HBlg 0,5 ml sebelum bayi berumur 7 hari. o 1 bulan : Hb-2 diberikan pada umur 1 bulan, interval HB-1 dan HB-2 adalah 1 bulan. o 6 bulan : HB-3 diberikan umur 6 bulan. Untuk mendapatkan respons imun optimal, interval HB-2 dan HB-3 minimal 2 bulan, terbaik 5 bulan 3. Apa tujuan dari pemberian vaksin polio? Jawab : Memicu antibody dalam darah sehingga menghasilkan pertahanan lokal terhadap virus polio liar. 4. Pada saat usia berapakah dan kapankah vaksinasi campak? Jawab : Sebanyak 2 kali; 1 kali di usia 9 bulan, 1 kali di usia 6 tahun. Dianjurkan, pemberian campak ke-1 sesuai jadwal. Selain karena antibodi dari ibu sudah menurun di usia 9 bulan, penyakit campak umumnya menyerang anak usia balita. Jika sampai 12 bulan belum mendapatkan

vaksinasi campak, maka pada usia 12 bulan harus divaksinasi MMR (Measles Mump Rubella). 5. Adakah efek samping dari Vaksinasi? Jawab : Terdapat efek samping dari vaksinasi, yang dari setiap vaksinasi memiliki efek samping yang berbeda-beda.

GLOSARIUM

Vaksin

: bahan antigenik yang digunakan untuk menghasilkan kekebalan aktif terhadap suatu penyakit sehingga dapat mencegah atau mengurangi pengaruh infeksi oleh organisme alami atau liar.

Virus

: mikroorganisme terkecil yang tidak memiliki sel dan hanya mempunyai kode genetik saja. Virus hidup sebagai parasit obligat yang menginfeksi sel inang. : cabang dari ilmu fisik yang mempelajari tentang susunan, struktur, sifat, dan perubahan materi.

Patogen

: mikroorganisme parasit. Umumnya istilah ini diberikan untuk agen yang mengacaukan fisiologi normal hewan atau tumbuhan multiselular.

Imunitas

: sistem mekanisme pada organisme yang melindungi tubuh terhadap pengaruh biologis luar dengan mengidentifikasi dan membunuh patogen serta sel tumor.

Polio

: penyakit virus yang sangat mudah menular dan menyerang sistem saraf, khususnya pada balita yang belum melakukan vaksinasi polio

Antibodi

: glikoprotein dengan struktur tertentu yang disekresikan oleh sel B yang telah teraktivasi menjadi sel plasma, sebagai respon dari antigen tertentu dan reaktif terhadap antigen tersebut.

Alergi

: respon abnormal dari sistem kekebalan tubuh.

OPV

: OPV kepanjangan dari Oral Polio Vaccine merupakan vaksin polio yang mengandung virus polio yang dilemahkan. Vaksin ini diberikan dengan cara meneteskan dimulut.

IPV

: IPV kepanjangan dari Inactivated Polio Vaccine merupakan vaksin polio buatan Jonas Salk. Berbeda dengan OPV, IPV menggunakan virus polio yang dimatikan. Pemberiannya dilakukan dengan cara disuntik. Vaksin polio ini memberikan perlindungan di dalam darah.

BAGIAN 6

SUB TOPIK/SUB JUDUL

: Jaminan mutu pemeriksaan virologi

TUJUAN INSTRUKSIONAL

: Mampu melakukan proses jaminan mutu pemeriksaan virologi

INDIKATOR URAIAN MATERI

: :

Mutu adalah tingkat kesempurnaan dan penampilan sesuatu yang sedang diamati, sifat yang dimiliki oleh suatu program, kepatuhan terhadap standar yang telah ditetapkan, serta sifat wujud dari mutu barang atau jasa yang dihasilkan, yang didalamnya terkandung sekaligus pengertian akan adanya rasa aman atau terpenuhinya para pengguna barang atau jasa yang dihasilkan tersebut (Azwar,1994). Menurut Suardi (2003), mutu berarti pemecahan masalah untuk mencapai perbaikan yang berkesinambungan.

Sedangkan menurut Wijono

(2000), mutu adalah kepatuhan terhadap standar dan keinginan pelanggan sehingga memenuhi kepuasan pelanggan. Perlu disadari bahwa semakin tinggi tingkat pendidikan dan kesejahteraan masyarakat, tuntutan akan pelayanan kesehatan yang bermutu semakin meningkat. Oleh karena itu pelayanan rumah sakit yang bermutu, baik di bidang diagnostik maupun pengobatan semakin dibutuhkan. Mutu sering digambarkan sebagai sesuatu yang hebat dan superior. Produk atau pelayanan yang bermutu dianggap sebagaisesuatu yang baik, cepat, dapat diandalkan dan mahal. Stamatis (1996) mengatakan bermutu tidak memerlukan biaya mahal tetapi mutu yangrendah akan menyebabkan biaya mahal. Pada pelayanan laboratorium, mutu hasil pemeriksaan laboratorium yang rendah akan mengakibatkan penambahan biaya yang dikeluarkan oleh pihak laboratorium untuk kegiatan pengerjaan ulang dan menimbulkan kerugian di pihak pengguna jasa dalam membantu menegakkan diagnosis penyakit.

A.

QUALITY CONTROL Quality Control (QC) adalah salah satu komponen dalam proses kontrol

dan merupakan elemen utama dari sistem manajemen mutu. Memonitor proses yg berhubungan dengan hasil tes serta dapat mendeteksi adanya error yang bersumber dari alat, keadaan lingkungan atau operator. Memberikan keyakinan bagi laboratorium bahwa

hasil yg dikeluarkan adalah akurat & reliabel.

Laboratorium harus menyusun program QC.

Quality control meliputi : 1. QC reagen : verifikasi reagen 2. QC instrumen : pengecekan fungsi instrumen, prosedur pemeliharaan instrumen

Proses Quality Control 1. QC harian : QC Internal | Sampel pasien

-- Analisis

-- Hasil pasien

| QC Eksternal.

| Diagnosa/treatment

2. QC periodik : Harus lebih diperhatikan (3 bulan, 6 bulan, dst)

Program Quality Control Yang Baik 1. Memantau kinerja pemeriksaan (metode, reagen, instrumen, alat lab, SDM) tolok ukur = akurasi dan presisi. 2. Mengidentifikasi masalah pemeriksaan 3. Menilai keandalan hasil pemeriksaan

Prosedur QC yang tepat dan penerapannya yang benar meliputi : 1. Perhitungan yang tepat untuk mendapatkan nilai x (mean) dan standar deviasi (SD) 2. Membuat batas kontrol yang tepat 3. Menggunakan aturan kontrol yang tepat sehingga dapat mendeteksi setiap sinyal-sinyal "out of control" yang mewakili masalah yang sesungguhnya 4. Kebutuhan terhadap frekuensi pengukuran bahan kontrol dengan hasil yang tepat

Jenis QC Di Laboratorium 1. Control limit : digunakan untuk menilai suatu prosedur pemeriksaan in control atau out control. Batasan kontrol dihitung dari nilai rata-rata dan standar deviasi dari hasil pengukuran kontrol. Perhatikan data sebelumnya untuk mengetahui akurasi 2. Control chart : metode grafik untuk menampilkan hasl kontrol dan mengevaluasi apakah suatu prosedur pemeriksaan in control atau out control 3. Control rule : suatu ukuran/standar untuk memberikan keputusan terhadap perjalanan suatu pemeriksaan apakah in control atau out control

Implementasi Memilih bahan kontrol : a) Homogen & Stabilitas lama . b) Kemasannya ( volum & jumlah ) disesuaikan kebutuhan. c) Matrix mirip dengan spesimen manusia. d) Konsentrasinya signifikan secara

klinik misalnya normal & tinggi atau

normal & rendah. e) Pergantian lot number lama

Persiapan & penyimpanan bahan kontrol a) Ikuti instruksi dari pabrik / vendor. b) Gunakan pipet terkalibrasi ( pipet gondok ) untuk rekonstitusi bahan kontrol. c) Setelah direkonstitusi, aliquot lalu simpan di feezer dalam kemasan kecil sesuai kebutuhan. d) Jika hendak digunakan , keluarkan 1 aliquot dr feezer e) Jangan beku ulang bahan kontrol. f) Monitor & maintenance suhu feezer untuk menghindari terjadinya degradasi zat bahan kontrol.

Guidelines

-

CLIA 88 , CLSI a. Minimum 2 level dalam 24 jam b. Frekuensi tiap 8 jam

-

Tergantung jumlah tes : < 50 tes/ hari

----- 1 level / 1 kali per hari

50- 100 tes/hari ----- 2 level / 1 kali per hari > 100 tes / hari ----- 2 level / 2 kali per hari c. jika statistik IQC tidak cukup , dpt menggunakan spesimen pasien

Kapan Menjalankan QC a) Setiap hari sebelum sampel pasien b) Menggunakan alat, reagen & metode baru c) Tergantung kestabilan reagen d) Setelah melakukan preventive maintenance e) Setelah pergantian suku cadang f) Ada masalah dalam aplikasi klinik dari hasil pasien g) Tindakan koreksi terhadap “error” h) Pelatihan & kompetensi terhadap operator.

Menetapkan Nilai Range Kontrol a) Siapkan bahan kontrol yg sudah dipilih ( low, normal, high) b) Jalankan setiap kontrol sebanyak minimal 20 kali selama 20 - 30 hari. c) Lihat hasil kontrol “in control “ dlm range yg sudah ditetapkan oleh pabrik d) Kumpulkan minimal 20 data , lalu hitung rerata & SD

Nilai Range Kontrol 1. Sebelum menghitung nilai range kontrol : a. Jika ada 1 atau 2 data dengan nilai terlalu tinggi atau rendah, data tersebut harus dikeluarkan dalam perhitungan nilai rang ---- “outliers” b. Jika ada > 2 data outliers in 20 data Identifikasi & tangani masalahnya

Ulang pengumpulan data kontrol. 2. Pelaksanaan QC range harus meliputi semua operator yg melaksanakan pemeriksaan spesimen 3. Bahan kontrol diperlakukan sama seperti spesimen pasien.

Sistem Monitoring Hasil Kontrol Interpretasi hasil QC harian : Ada 3 kemungkinan : 1. In control a. Control value is within in limit control b. Control value in warning limit 2. In control but regarded as out of statistical 10 , 7 T , trend, shift 3. Out of kontrol Control value out of control limit

Sistematik Error a) Pergantian reagen / kalibrator b) Maintenance alat c) Salah nilai kalibrator d) Persiapan reagen tidak benar e) Deteriorasi reagen/kontrol/kalibrator f) Penyimpanan reagen & kalibrator tidak sesuai g) Perubahan suhu inkubator h) Perubahan prosedur i) Volum reagen atau spesimen tidak sesuai j) Mempengaruhi akurasi (bias, trend , shift ) k) Rules 2-2S, 4-1s(3-1s), 10-x (12-x), 7-T Random error a) Ada gelembung dalam reagen b) Kontaminasi pada reagen

c) Pencampuran reagen tidak adequat d) Tidak stabil suhu atau inkubator e) Tidak stabil sumber listrik f) Variasi operator dlm pipeting g) Mempengaruhi presisi Rules : 1-3s, R-4s Deviasi positif atau negatif dari mean (x) Penyimpangan QC harian umumnya terjadi pada keadaan sbb : 1. Perubahan no.lot/batch reagen dan kalibrator/standar 2. Setelah melakukan perawatan besar pada alat

Dokumentasi 1. Data QC & grafik 2. Data error, tipe error beserta penyebabnya 3. Problem solving & tindakan korektif 4. Data alat, reagensia, kalibrasi 5. Preventif maintenance & troubleshooting

a) Program QC berperan dalam menilai akurasi & realibility hasil lab. b) Laboratorium harus membuat program QC untuk monitor hasil lab. c) Ada kebijakan & prosedur pelaksaaan QC yg harus diikuti semua staf d) Training semua staf secara terus menerus terhadap prosedur yang berhubungan dengan mutu. e) Tanggung Jawab QC dibawah seorang manajer mutu yg memonitor & review semua data f) Untuk monitoring proses

QC , digunakan analisa secara statistik,

menggunakan grafik L-J g) Jika kontrol out of range , maka segera lakukan tindakan korektif & trouble shooting, sebelum mengeluarkan hasil pasien h) Semua data yang berhubungan dengan QC harus didokumentasikan secara lengkap & mudah untuk diakses

B. PENGENDALIAN PRA ANALITIK Pengendalian pra analitik adalah serangkaian kegiatan laboratorium saat pelayanan dimulai pada pasien berupa penerimaan pasien, pengambilan spesimen, pelabelan spesimen, penerimaan spesimen, penilaian spesimen, pengolahan spesimen hingga pengiriman spesimen dengan maksud agar spesimen benar-benar representatif sesuai dengan keadaan pasien, tidak terjadi kekeliruan jenis spesimen, dan mencegah tertukarnya spesimen-spesimen pasien satu sama lainnya.

Tujuan Untuk menjamin bahwa spesimen-spesimen yang diterima benar dan dari pasien

yang

benar

pula.

Cara Pengendalian 1. Menyediakan Katalog pemeriksaan, berisi informasi : Persyaratan pasien & Jenis spesimen. 2. Cara pengambilan & volume. 3. Wadah Spesimen 4. Pengiriman & Penyimpanan Spesimen 5. Menyediakan Prosedur Operasi Baku (SOP), antara lain : SOP penanganan spesimen dan sampel. 6. Menyediakan pedoman-pedoman, antara lain : Pengambilan spesimen yang benar, Persyaratan spesimen dan persiapan pasien, Persyaratan sampel

Kegiatan Pra Analitik 1. Persiapan pasien secara umum dan yang mempengaruhi 2. Mempersiapkan pasien untuk pengambilan spesimen sesuai persyaratan umum dan khusus pemeriksaan.

3. Menghindari pemakaian obat-obatan sebelum spesimen diambil di laboratorium. 4. Menghindari aktifitas fisik/olah raga sebelum spesimen diambil 5. Memperhatikan efek postur, pengambilan darah paling baik dengan duduk tenang dibandingkan berdiri karena keseimbangan cairan akan terganggu. 6. Diet makan dan minum pasien dapat mempengaruhi hasil pemeriksaan laboratorium. 7. Merokok

dan

minum

alkohol

mempengaruhi

hasil

pemeriksaan

laboratorium. 8. Ketinggian suatu tempat (geografis) berpengaruh pada hasil pemeriksaan laboratorium. 9. Demam akan menyebabkan kenaikan dan penurunan beberapa parameter pemeriksaan, waktu demam yang tepat akan dapat membantu menegakkan diagnosis. 10. Trauma dapat menyebabkan terjadi hemostasis hingga pengenceran darah. 11. Variasi Circadian Rythme merupakan perubahan dari waktu ke waktu pada tubuh yang dipengaruhi waktu, siklus dan umur. 12. Umur, ras, dan jenis kelamin paling berpengaruh terhadap hasil pengukuran dan nilai rujukan 13. Kehamilan pada wanita perlu dipertimbangkan lama kehamilan yang berpengaruh pada pengenceran.

Pengambilan a.

Spesimen

Peralatan yang digunakan harus memenuhi persyaratan tertentu : 1. Bersih, kering, tidak mengandung bahan kimia/deterjen, 2. Terbuat dari bahan yang tidak mempengaruhi spesimen. 3. Mudah dicuci atau dibersihkan dari sampel sebelumnya. 4. Pengambilan spesimen untuk pemeriksaan biakan harus menggunakan peralatan yang steril.

b.

Wadah spesimen harus memenuhi : 1. Terbuat dari gelas atau plastik. Untuk spesimen darah harus terbuat dari gelas. 2. Tidak bocor atau merembes. 3. Harus dapat ditutup rapat dengan tutup berulir. 4. Besar wadah disesuaikan dengan volume spesimen 5. Bersih dan kering 6. Tidak mempengaruhi sifat zat-zat dalam spesimen 7. Tidak mengandung bahan kimia atau deterjen. 8. Untuk pemeriksaan zat dalam spesimen yang mudah rusak atau terurai karena pengaruh sinar matahari, maka digunakan botol coklat. 9. Untuk pemeriksaan biakan dan uji kepekaan kuman wadah harus steril.

c. Pengawet : Diberikan agar sampel yang akan diperiksa dapat dipertahankan kondisi dan jumlahnya dalam waktu tertentu. Antikoagulan digunakan untuk mencegah pembekuan darah.

d. Waktu : Pada umumnya pengambilan spesimen dilakukan pada pagi hari, terutama untuk pemeriksaan virologi karena umumnya nilai normal ditetapkan pada keadaan basal.

e. Lokasi : Sebelum mengambil spesimen, harus ditetapkan terlebih dahulu lokasi pengambilan yang tepat sesuai dengan jenis pemeriksaan yang diminta. Spesimen untuk pemeriksaan menggunakan darah vena umumnya diambil dari vena cubiti daerah siku. Spesimen darah arteri umumnya diambil dari arteri radialis di pergelangan tangan atau arteri femoralis di daerah lipat paha. Spesimen darah kapiler diambil dari ujung jari tengah tangan atau jari manis tangan bagian tepi atau pada derah tumit 1/3 bagian tepi telapak kaki atau cuping telingan pada bayi. Tempat yang dipilih tidak boleh memperlihatkan gangguan peredaran darah seperti cyanosis

atau pucat, bekas luka dan radang

f. Volume : Volume spesimen yang diambil harus mencukupi kebutuhan pemeriksaan laboratorium yang diminta atau dapat mewakili objek yang diperiksa.

g. Teknik Pengambilan : Pengambilan spesimen harus dilaksanakan dengan cara yang benar, agar spesimen tersebut mewakili keadaan yang sebenarnya.

Pemberian Identitas Spesimen Pemberian identitas pasien dan atau spesimen merupakan hal yang penting baik pada saat pengisian surat pengantar/formulir permintaan pemeriksaan, pendaftaran, pengisian label wadah spesimen. Pada surat pengantar/formulir permintaan pemeriksaan laboratorium sebaiknya memuat secara lengkap : - Tanggal permintaan - Tanggal dan jam pengambilan spesimen -

Identitas pasien (nama, umur, jenis kelamin, alamat/ruang) termasuk rekam

medik. -

Identitas pengirim (nama, alamat, nomor telepon)

-

Nomor laboratorium

-

Diagnosis .keterangan klinik.

-

Obat-obatan yang telah diberikan dan lama pemberian.

-

Pemeriksaan laboratorium yang diminta.

-

Jenis spesimen

-

Lokasi pengambilan spesimen

-

Volume spesimen dan Pengawet yang digunakan

-

Nama pengambil spesimen.

Pengolahan Spesimen

Spesimen yang telah diambil dilakukan pengolahan untuk menghindari kerusakan pada spesimen tersebut. Pengolahan spesimen berbeda-beda tergantung dari jenis spesimennya masing-masing. 1). Serum Biarkan darah membeku terlebih dahulu pada suhu kamar selama 2-30 menit, lalu di sentrifuge 3000 rpm selama 5-15 menit. Pemisahan serum dilakukan dalam waktu 2 jam setelah pengambilan darah. Serum yang memenuhi syarat harus tidak kelihatan merah dan keruh.

2). Plasma Kocok darah EDTA atau citrat dengan segera secara perlahan-lahan. Pemisahan plasma dilakukan dalam waktu 2 jam setelah pengambilan spesimen. Plasma yang memenuhi syarat harus tidak kelihatan merah dan keruh.

3). Whole blood Darah yang diperoleh ditampung dalam tabung yang telah berisi antikoagulan yang sesuai, lalu dihomogenisasi dengan cara goyang perlahan tabung.

4). Urine Urine yang didapatkan tidak perlu ada perlakuan secara khusus, kecuali pemeriksaan harus segera dilakukan sebelum 1 jam, sedangkan untuk pemeriksaan sedimen harus dilakukan pengolahan terlebih dahulu dengan cara dimasukkan tabung dan sentrifuge selama 5 menit 1500-2000 rpm, supernatan dibuang dan diambil sedimennya. Suspensi sedimen ini dicampur dengan cat Sternheirmer-Malbin Stain’s untuk menonjolkan unsur sedimen dan memperjelas strukturnya.

5). Sputum Masukkan sputum ke dalam tabung steril yang berisi NaOH 4% sama banyak. Kocok dengan baik. Inkubasi pada suhu kamar 25-30OC selama 15-20 menit

dengan pengocokan teratur tiap 5 menit. Sentrifuge dengan kecepatan tinggi selama 8-10 menit. Endapan diambil dan supernatan dibuang pada air lysol.

Menilai Spesimen Yang Tidak Memenuhi Syarat 1. Spesimen diterima oleh petugas loket dan sampling. 2. Penilaian spesimen harus dilakukan sesuai dengan jenis pemeriksaan. 3. Penilaian spesimen harus segera dilakukan setelah menerima spesimen. 4. Petugas laboratorium wajib menolak dan mengembalikan spesimen yang tidak memenuhi syarat pemeriksaan. 5. Spesimen yang ditolak diberitahukan lewat via aiphone ruangan atau yang mengantar spesimen. 6. Kriteria penilaian dapat dilihat pada tabel dibawah ini

Penyimpanan Spesimen Spesimen yang sudah diambil harus segera dikirim ke laboratorium untuk diperiksa, karena stabilitas spesimen dapat berubah. Faktor-faktor

yang

mempengaruhi stabilitas spesimen antara lain : a.

Terjadi kontaminasi oleh kuman dan bahan kimia.

b.

Terjadi metabolisme oleh sel-sel hidup pada spesimen.

c.

Terjadi penguapan.

d.

Pengaruh suhu.

e.

Terkena paparan sinar matahari.

Beberapa spesimen yang tidak langsung diperiksa dapat disimpan dengan memperhatikan jenis pemeriksaan yang akan diperiksa. Persyaratan penyimpanan beberapa

spesimen

untuk

beberapa

pemeriksaan

laboratorium

harus

memperhatikan jenis spesimen, antikoagulan/pengawet dan wadah serta stabilitasnya.

Beberapa cara penyimpanan spesimen : a.

Disimpan pada suhu kamar

b.

Disimpan dalam lemari es suhu 2-8OC

c.

Dibekukan suhu -20OC, -70OC atau -120OC

d.

Dapat diberikan bahan pengawet

e.

Penyimpanan spesimen darah sebaiknya dalam bentuk serum atau lisat.

Pengiriman Spesimen 1. Spesimen yang akan dikirim ke laboratorium lain, sebaiknya dikirim dalam bentuk yang reatif stabil. Untuk itu perlu diperhatikan persyaratan pengiriman spesimen antara lain : 2. Waktu pengiriman jangan melampaui masa stabilitas spesimen. 3. Tidak terkena sinar matahari langsung 4. Kemasan harus memenuhi syarat keamanan kerja laboratorium termasuk pemberian label yang bertuliskan “Bahan Pemeriksaan Infeksius” atau “Bahan Pemeriksaan Berbahaya”. 5. Suhu pengiriman harus memenuhi syarat.

Mempertahankan Mutu Pra Analitik 1. Mengerjakan proses/prosedur sesuai standar (SPO) yang telah ditentukan. 2. Melaksanakan dan mengevaluasi program QC. 3. Pengawasan dan monitoring kegiatan harian untuk mengurangi kesalahankesalahan yang mungkin muncul. 4. Ketersediaan anggaran dana dan personil yang memadai untuk kegiatan. 5. Pendidikan dan pelatihan berkelanjutan staf laboratorium. 6. Adanya dukungan penuh dari pihak manajemen dalam melakukan pelayanan yang standar dan bermutu

RINGKASAN :

Laboratorium dapat menentukan jumlah, jenis, dan frekuensi dalam pengerjaan kontrol. Jika kontrol tidak ada, laboratorium harus mempunyai mekanisme alternatif untuk deteksi cepat kesalahan proses analisis. Memantau proses

pemeriksaan

control) untuk

menggunakan

mendeteksi,

teknik

meminimalisasi,

statistik (statistical mencegah,

quality

memperbaiki

penyimpangan yang terjadi selama proses analisis berlangsung. Statistical quality contol (SQC) berguna untuk memantau perubahan yang terjadi pada alat, reagen, kalibrator, dan prosedur kerja. 1. Tetapkan sasaran mutu/nilai target QC 2. Pilih bahan kontrol yang benar 3. Tetapkan level kontrol yang akan dikerjakan 4. Tetapkan frekuensi kerja kontrol 5. Tetapkan rules QC yang digunakan 6. Analisa dan kenali kesalahan QC yang dapat terjadi 7. Kendalikan hal-hal yang mempengaruhi QC (mutu reagen, mutu alat, kualitas SDM, prosedur dan kesinambungan supply)

LATIHAN PEMAHAMAN

:

1. Salah satu program quality control yang baik adalah memantau kinerja pemeriksaan yang meliputi dibawah ini, kecuali ... a. Metode b. Reagen c. Instrumen d. SDM e. Kebijakan penanggung jawab lab 2. Yang termasuk kedalam salah satu jenis QC di laboratorium adalah ... a. Control limit b. Contol bahan c. Control alat d. Control SDM

e. Control akurasi 3. Berikut ini yang bukan termasuk kedalam persiapan dan penyimpanan bahan control adalah ... a. Ikuti instruksi dari pabrik / vendor. b. Gunakan pipet terkalibrasi ( pipet gondok ) untuk rekonstitusi bahan kontrol. c. Monitor & maintenance suhu feezer untuk menghindari terjadinya degradasi zat bahan kontrol. d. Lakukan pemeriksaan sesuai dengan suasana hati e. Jangan beku ulang bahan kontrol. 4. Yang termasuk kedalam sistem monitoring hasil kontrol adalah ... a. In control, In control but regarded as out of statistical dan Out of kontrol b. In control, In control but regarded as out of statistical dan Out of topic c. In topic, In control but regarded as out of statistical dan Out of kontrol d. In control, out control but regarded as out of statistical dan Out of kontrol e. In control dan Out of kontrol 5. Yang tidak termasuk kedalam cara untuk mempertahankan mutu pra analitik adalah ... a. Mengerjakan proses/prosedur sesuai standar (SPO) yang telah ditentukan. b. Melaksanakan dan mengevaluasi program QC. c. Pengawasan dan monitoring kegiatan harian untuk mengurangi kesalahan-kesalahan yang mungkin muncul. d. Mengerjakan proses/prosedur sesuai standar (SPO) yang telah ditentukan, bila tidak ada prosedur sesuai standar (SPO) maka tidak perlu dikerjakan.

e. Adanya dukungan penuh dari pihak manajemen dalam melakukan pelayanan yang standar dan bermutu

GLOSARIUM 1. Akurasi (ketepatan) -> menyatakan kesesuaian hasil pemeriksaan dengan nilai benar (actual value). Secara kuantitatif disebut inakurasi yang dihitung sebagai perbedaan nilai rata-rata pemeriksaan replikat (berulang-ulang) dengan nilai benar.

2. Presisi (ketelitian) -> kesesuaian antara hasil-hasil pada pemeriksaan berulang. Secara kuantitatif disebut impresisi yaitu penyimpangan dari hasil pemeriksaan terhadap nilai rata-rata 3. QC di ibaratkan seperti "alarm asap" yang mendeteksi secara cepat adanya asap sebelum kebakaran menjadi lebih besar.

(BERISI DAFTAR ISTILAH, DISUSUN SESUAI ALFABET)

DAFTAR PUSTAKA

DAFTAR PUSTAKA Balai Penyuluhan Pertanian Kembang Kuning. 2011. Penyakit Tetelo. Bogor. Hewajuli, D. A.,

& Harmayanti P. I.D. 2011. Patogenitas Virus Newcastle

Disease Pada Ayam. Wartazoa. 21 (2). Juhanda, T. 1981. Embriologi Perbandingan. Bandung: Armico. Manz, B., Schwemmle, M., & Brunotte L. 2013. Adaptation of Avian Influenza A Virus Polymerase in Mammals To Overcome the Host Species Barrier. Journal of Virology p. 87 (13), pp. 7200–7209. Nayak, Baibaswata, Subrat N. Rout, Sachin Kumar, Mohammed S. Khalil, Moustafa M.Fouda, Luay E. Ahmed, Daniel R.Perez, Peter L. Collins, Siba, K. Samal.2012. Immunization of Chickens with Newcastle Disease

Virus Expressing H5 Hemagglutinin Protects against Highly Pathogenic H5N1

Avian Influenza Viruses. NDV Vectored Vaccines for AIV. 4 (4),

pp. 21-26. Papaji.

2011.

Penyakit

Tetelo

Newcastle

Disease.

http://papaji.forumotion.com/t4882-penyakit-tetelo-newcastle-desease. Radji, M. 2010. Imunologi dan Virologi. Jakarta: PT Isfi Penerbitan. Shane, M. 1998. Buku pedoman penyakit unggas. Singapore: American Soybean Assosiation. JAWETZ,Ernest.1995. Mikrobiologi Kedokteran(Medical Microbiology)/ Ernest Jawetz, Joseph Melnick & Edward Aelberg. Alih bahasa, Edi Nugroho, R.F. Maulany (ed). Irawati Setiawan-Ed.20-Jakarta: EGC. Staf Pengajar Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. 1994. Buku Ajar Mikrobiologi Kedokteran. Jakarta: Binarupa Aksara. http://pustaka.unpad.ac.id/wp-content/uploads/2011/03/biologimolekul_virus.pdf http://fpk.unair.ac.id/webo/kuliahpdf/VIRUS%20S2ppt%20%5BCompatibility%20Mode %5D.pdf http://file.upi.edu/Direktori/FPMIPA/JUR._PEND._BIOLOGI/196805091994031KUSNADI/BAb_V_I__R_U_S.OK.pdf

http://muhammadnurawal.blogspot.com/2011/12/struktur-tubuh-virus-danpenjelasannya.html http://id.wikipedia.org/wiki/Adenoviridae http://pisangkipas.wordpress.com/2009/05/19/adenoviruses/ http://fauzi-madiun.blogspot.com/2011/09/adenovirus.html http://reyza-050510.blogspot.com/2013/05/makalah-virus-herpes.html

https://www.academia.edu/6472393/Hsv_Jadi http://mikrobia.files.wordpress.com/2008/05/noviani-lestari-t-078114132.pdf http://herpesgenital.biz/sembilan-jenis-virus-herpes-ditemukan-pada-manusia/ http : // kamriantri.wordpress.com/tag/parvoviridae. Diakses pada tanggal 26 September 2014. Pukul : 15.00 WIB http : // en.m.wikipedia.org/wiki/adeno-associated-virus. Diaksses pada tanggal 27 September 2014. Pukul : 08.09 WIB http : // en.m.wikipedia.org/wiki/Canine-parvovirus. Diakses pada tanggal 27 September 2014. Pukul 09.11 WIB http : //kartikaelizabeth.blogspot.com/parvovirus. Diakses pada tanggal 28 September 2014. Pukul : 10.05 WIB

Addy, H. S., Askora, A., Kawasaki, T., Fujie, M., & Yamada, T. 2012. Utilization of filamentous phage φRSM3 to control bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum. Plant Dis. 96(1), pp. 1204-1209. Azizi, Norita, Fatitik. 2015. Isolasi Dan Karakterisasi Bakteriofag Yang Menginfeksi

Bakteri Ralstonia solanacearum. SKRIPSI. Universitas

Negeri Jember. Buana, E. O. G. H. N, & Wardani, A. K. 2014. Isolasi Bakteriofag Litik Sebagai Agen Biosanitasi Pada Proses Pelisisan Bakteri Pembentuk Biofilm. Jurnal Pangan dan Agroindustri. 2 (2), pp. 36-42. Campbell, N. A. 2004. Biologi. Jakarta : Erlangga. Deri, A. 2008. Jenis atau Macam Daur Infeksi Virus (Litik dan Lisogenik). Yogyakarta: Kanisius. Dulbecco, R., & Vogt, M. 1953. Beberapa permasalahan virologi hewan yang dipelajari oleh teknik plaque Spring. Cold Harbor gejala. Quant. Biol 18. 273-279

Hatano, Ben, A. Kojima, T. Sata, & H. Katano. 2010. Virus detection using viro adembeads, a rapid capture system for viruses, and plaque assay in intentionally virus contaminated beverages. J. Infect. Dis. 63: 52-54 Irnaningtyas. 2013. Biologi Untuk SMA/MA Kelas X. Jakarta: Erlangga. Iswadi. 2012. Isolasi Fage Litik Spesifik Shigella sp.. Jurnal Ilmiah Pendidikan Biologi. 4(2), pp. 112-117. Kaufmann, S.H., Kabelitz, D. 2002. Methods in Microbiology: Immunology of Infection. Academic. 32(2). Nindita, L. O. & Wardani, A. K. 2013. Purifikasi Phage Cocktail Serta Spektrum Penghambatannya Terhadap Bakteri Penyebab Foodborne Disease. Jurnal Teknologi Pertanian. 14(1), pp. 47-56 Suryati. 2007. Prosedur Diagnostik Dengan Metode Klasik Dan Metode Molekuler. IPB: Bogor. Smith, K.M. 1980. Introduction to Virology. London: Chapman and Hall. https://www.vbook.pub.com/document/349458954/Plaque Muslihatun, Wafi Nur. 2010. Asuhan Neonatus Bayi dan Balita.Yogyakarta : Fitramaya. Depkes, RI .1993. Asuhan Kesehatan Anak dalam Konsep Keluarga, Cetakan II. Jakarta Muslihatun, Wafi Nur. 2010. Asuhan Neonatus Bayi dan Balita.Yogyakarta : Fitramaya Achmadi, Umar Fahmi. 2006. Vaksinasi Mengapa Perlu?. Jakarta: PT Kompas Media Indonesia. Buku Panduan Vaksinasi Indonesia, Jilid II. 2005 Departement Kesehatan RI. 1993. Asuhan Kesehatan Anak dalam Konsep keluarga. Maslam. 1997. Vaksinasi Edisi II. Jakarta : Ficus http://digilib.unimus.ac.id/files/disk1/143/jtptunimus-gdl-rrdewiretn-7117-3babiit-a.pdf diakses pada 10 oktober 2017 pukul :16.00