Aqiela Rusydi - Methanopyrus Kandleri

Methanopyrus kandleri adalah bakteri metanogenik berbentuk batang, gram positif, yang diisolasi dari ventilasi termal yang dalam di Teluk California .Organisme ini adalah yang pertama diketahui methanogen hipertermofilik yang tumbuh pada suhu di atas hingga 110 ° C (16). Meskipun thermophily ekstrim telah ditemukan dalam tiga kelompok prokariota yang secara filogenetik berbeda (the eubacteria, methanogens dan kerabat mereka, dan eosit [hipertermofilik, terutama prokariota metabolisme sulfur]), anggota genus Pyrodictium adalah satu-satunya prokariota lain yang diketahui tumbuh pada suhu 110 ° C atau lebih tinggi. Atas dasar hasil 16s rRNA dan faktor pemanjangan sintesis protein 1-alpha (EF-la) analisis urutan, genus Pyrodictium diklasifikasikan sebagai takson eocyte . Rivera ,maria c. And james a. Lake.1996. The Phylogeny of Methanopyrus kandleri . International journal of systematic bacteriology. Vol. 46(1):348-351. Protein M. kandleri menunjukkan suatu kandungan asam amino bermuatan negatif yang luar biasa tinggi, yang mungkin merupakan adaptasi terhadap salinitas intraseluler yang tinggi. Sebelumnya Analisis filogenetik 16S RNA menunjukkan bahwa M. Kandleri milik cabang yang sangat dalam. methanogen archaeal bersifat monofiletik. Fitur khas M. kandleri adalah kekurangan protein yang terlibat dalam pensinyalan dan regulasi ekspresi gen. Juga, M. kandleri tampaknya memilikinya lebih sedikit gen yang diperoleh melalui transfer lateral daripada archaea lainnya. Ini fitur mungkin mencerminkan habitat ekstrim organisme ini. Methanopyrus kandleri diisolasi dari dasar laut di Teluk Bintuni dasar cerobong asap hitam 2,000 m di dalam Teluk California . Organisme ini adalah metanogen Grampositif berbentuk batang yang tumbuh secara chemolithoautotrophically 80–110 ° C di atmosfer H2 – CO2 (2). Penemuan Methanopyrus menunjukkan bahwa metanogenesis biogenik mungkin terjadi di atas 100 ° C dan dapat menjelaskan diskriminasi isotop pada suhu yang selama ini dianggap tidak menguntungkan bagi biologis Aspek-aspek tertentu dari biokimia M. kandleri adalah ; membran M. kandleri terdiri dari lipid terpenoid , yang dianggap lipid paling primitif dalam evolusi membran . Hal lain yang tidak biasa dari M. kandleri adalah tinggi konsentrasi intraseluler (1,1 M) dari anion trivalen, siklik 2,3-diphosphoglycerate, yang telah dilaporkan memberi aktivitas dan stabilitas pada suhu tinggi pada enzim dari organisme ini.

enzim yang diisolasi dari M. kandleri membutuhkan konsentrasi garam tinggi (1 M) untuk stabilitas dan aktivitas . Akhirnya, M. kandleri memiliki beberapa enzim unik, yang paling banyak yang terkenal adalah tipe 1B DNA topoisomerase V dan dua sub unit reverse gyrase . Slesarev , Alexei I , Katja V. Mezhevaya, Kira S. Makarova, Nikolai N. Polushin, Olga V. Shcherbinina, Vera V. Shakhova, Galina I. Belova, L. Aravind, Darren A. Natale, Igor B. Rogozin, Roman L. Tatusov, Yuri I. Wolf, Karl O. Stetter Andrei G. Malykh, Eugene V. Koonin, and Sergei A. Kozyavkin.2001.The complete genome of hyperthermophile Methanopyrus kandleri AV19 and monophyly of archaeal methanogens . Journal Proceeding of the National Academy of Science of the United States of America (PNAS). Vol 99 (7) : 4644–4649.